陈文峰的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/陈文峰 专注于根瘤菌的研究

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推荐:植物-微生物互作的博客
2014-10-10 08:11
Plants and Microbes , Everything related to the science of plant-microbe interactions Curated by: Kamoun Lab @ TSL http://www.scoop.it/t/mpmi
个人分类: 根瘤菌与豆科植物分子相互作用|10622 次阅读|没有评论
基因组比较表明MAFF303099与Mesorhizobium huakuii 7653R同种
2014-6-13 14:19
华中农业大学李友国教授课题组新近发表在BMC Genomics上的一篇论文,全面报道 Mesorhizobium huakuii 7653R的全基因组,并与MAFF303099的基因组进行了比较,结果发现,MAFF303099与 M. huakuii 应为同一个种,但两者的共生特性不同。7653R对宿主的专一性很强,只与紫云英( Astragalus sinicus )结瘤固氮;而MAFF303099 ...
个人分类: 根瘤菌基因组学|10696 次阅读|没有评论
无限和有限根瘤(indeterminate and indeterminate nodules)
2014-5-28 17:21
无限根瘤(indeterminate nodules,或称为非定型根瘤)和有限根瘤(determinate nodules,或称为定型根瘤)示意图 摘自: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1469-8137.2004.01285.x/pdf Determinate nodules are found on certain tribes of tropical legume such as those of the genera Glyc ...
个人分类: 根瘤菌与豆科植物分子相互作用|14081 次阅读|没有评论
全基因组测序将成为细菌分类必须做的一项指征
2014-5-20 11:27
2014年3月份的 Antonie Van Leeuwenhoek杂志上,Vandamme和Peeters联合撰文,提议以后的细菌多相分类中,特别是新种的鉴定与发表中,必须增加全基因组信息,以及采用快速高效的表型鉴定系统对细菌必需特征进行测定。而最近我投到SAM(Syst. Appl. Microbiol.)的一篇新种论文,编辑也以没有模式菌株的基因组信息(the genom ...
个人分类: 根瘤菌进化、发育与系统学|8941 次阅读|没有评论
缅怀Gisèle Laguerre,根瘤菌分类学家
2014-4-30 21:03
今天与来自突尼斯的Bacem交流,得到 Gisèle Laguerre 去世了。2013年1月16日因为肺癌去世的,年仅55岁。我对Laguerre记忆最深的是经常引用她的一篇论文,可以说,现在我们常使用的扩增 nodC 和 nifH 的引物就是根据这篇论文中设计的。google是查了下,这篇论文被引用了280次了。 Classification of r ...
个人分类: 生活、其它|8241 次阅读|没有评论
用R语言统计一下LPSN网站上的各属内的物种数
2014-4-20 22:19
#使用R语言,可以将LPSN网站( http://www.bacterio.net )上的感兴趣的细菌的属下的物种数统计出来并做图: library(stringr) #统计中华根瘤菌属( Sinorhizobium ) SinorhizobiumPage - readLines(http://www.bacterio.net/sinorhizobium.html) grep('Number of species', SinorhizobiumPage ...
个人分类: 根瘤菌分类|10556 次阅读|没有评论
根瘤菌类群的一个新属:Neorhizobium gen. nov.
2014-4-16 16:17
芬兰的Mousavi等人新近提出了一新的属, Neorhizobium gen. nov.,它是将之前发表的几个新种合并到一起,并提出新的属,属名命名为新根瘤菌属( Neorhizobium )。详见这里: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0723202014000204 Abstract The genera Agrobacterium , Allorhizobium , and Rhiz ...
个人分类: 根瘤菌分类|8994 次阅读|没有评论
根瘤菌与豆科植物之间的“互接种族”
热度 1 2014-3-20 15:16
传统的根瘤菌分类是建立在以宿主植物为中心的“互接种族”关系基础上的,属于不同互接种族的豆科植物则不能利用其根瘤菌相互接种、结瘤与固氮。常见的互接种族关系如下: (l)苜蓿族:包括苜蓿( Medicago )、草木樨( Melitotus )和葫芦巴( Trigonella )三属的植物。 (2)三叶草族:只有三叶草( Trifolium )一个属。 (3)豌豆族 ...
个人分类: 结瘤豆科植物|8995 次阅读|7 个评论 热度 1
一些豆科植物染色体的倍数及基因组信息
2014-2-11 16:44
关于一些豆科植物染色体的倍数及基因组的信息 摘录自: 《中国主要经济植物基因组染色体图谱》的第五册,收录了作者对我国123科403属563种药用植物染色体研究的资料。 包括染色体数目、倍性、核型分析的基本数据。这些染色体基础科学数据不仅对药用植物的杂交育种、细胞分类、种性鉴定、起源进化研 ...
个人分类: 豆科植物基因组学|15724 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2021-10-25 10:10

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