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中国2004年至2018年的动物狂犬病监测(4) 精选

已有 2708 次阅读 2020-12-14 15:40 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:科普集锦

中国2004年至2018年的动物狂犬病监测(4

Animal Rabies Surveillance, China, 2004–2018

美国CDC今年12月出版的专业杂志《Emerg Infect Dis.(新发传染病上,发表了军事医学科学院军事兽医研究所中国长春涂长春研究员等的这篇研究论文,提供了迄今为止最全面的中国RABV(狂犬病毒感染动物种类、地理分布、传播源和遗传多样性数据集现将该论文的主要内容进行摘译,此次发布的是第四部分:

结果
3. 中国及周边国家动物狂犬病的传播

贝叶斯轮廓模型(Bayesian skyline model分析结果显示,被测RABV平均核苷酸替代率为每年每位点3.50×104替换(95%最高后验密度为每年每位点2.90–4.11×104替换)。这一发现与之前对狗相关RABV N基因的进化变化分析结果一致(25)。亚分的演化速率差异不显著。中国与周边国家具有代表性的RABV共享tMRCA(最近共同祖先时间,提349563年前出现汇合点(图4)。进一步BEAST软件分析RABV分支的传播途径,可以发现狂犬病在中国不同边境地区发生了界传播。我们之前对G基因的分析结果一致,我们再次确定了SEA1 (贝叶斯因子Bayes factor 76.9)从中国印度尼西亚意义重大的迁移途径(附录表4)(5)(26)。

image.png 

4. 基于核蛋白N基因的狂犬病毒最大进化分支可信度credibility树。标明了这些估计的最近共同祖先时间tMRCA和它们95%最高后密度值highest posterior density values。除了附录表3末尾列出的5株疫苗株(https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/26/12/20-0303-App1.pdf)之外,使用与图1相同的序列。黑色实心方块表示来自中国的株。SEA表示东南亚(Southeast Asia

 

5.(地图请参看英文原文)建议贝叶斯随机搜索变量选择方法Bayesian stochastic search variable selection approach确定狂犬病毒在中国与国之间的跨界传播。线:贝叶斯因子Bayes factor>3的传播事件, 线:贝叶斯因子<3传播事件; SEA表示东南亚(Southeast Asia

此外,缅甸、泰国、老挝和越南的许多SEA3毒株与中国云南和广西的一些流行毒株在遗传上较为接近,如前所述说明中国与周边SEA国家之间存在相互传播(Bayes factor 4.385.0)(27)。在中国与哈萨克斯坦、俄罗斯、蒙古和韩国边境地区的草原型AL2也发现了同样的传播(贝叶斯因子3.17229.87)。最值得注意的事件是最近印度次大陆毒株从尼泊尔跨境传播到西藏边境地区,尽管贝叶斯因子较低(0.9),导致2017年一例人类狂犬病死亡(24)。

 

英文原文:

Feng Y, Wang Y, Xu W, Tu Z, Liu T, Huo M, et al. Animal Rabies Surveillance, China, 2004–2018.  Emerg Infect Dis. 2020;26(12):2825-2834. https://dx.doi.org/10.3201/eid2612.200303 

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