科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
RepeatModel+RepeatMasker 屏蔽重复序列遇到的问题
王庚申 2020-12-18 12:36
遇到的问题 运行的时候刚开始报错,我在网上查了一下,大概就是这个连结的问题,但是我实在是不知道怎么进行这种操作,所以就只能卸载了重装,效果明显。 /home/jungleblack/miniconda3/bin//rmblastn: symbol lookup error: /home/jungleblack/miniconda3/bin/../lib/ncbi-blast+/libmlacli.so: undefined symbol: ...
个人分类: 数据分析|1080 次阅读|没有评论
[起飞] Typora+Picgo 自动云端上传markdown中的图片并生成链接
王庚申 2020-12-17 11:02
Typora+Picgo 在做这个工作之前用Typora写文档插入的图片都要放到本地文件夹里,想着如果Markdown可以像写博客一样直接上传图片就方便多了,前几天看到Typora和Picgo结合了,然后就找教程试了一下,真是爽到飞起。 ​ 操作步骤其实很简单: 下载Picgo 去Picgo网站下载一下 网站链接 。 G ...
个人分类: 数据分析|964 次阅读|没有评论
[转载]聚类分析树之间的对比
王庚申 2019-9-13 11:49
昨天跑着《Numerical Ecology with R》(2018版)的代码,又出了一张很有意思的图。 这个图是用tanglegram{dendextend}画的,具体代码如下。 # Objects of class hclust must be first converted into objects of # class dendrogram class(spe.ch.ward) dend1 - as.dendrogram(spe.ch.ward) cl ...
个人分类: 数据分析|1696 次阅读|没有评论
[转载]用 googleVis 包画地图
王庚申 2019-9-8 15:55
因为赖江山老师翻译的《数量生态学——R语言的应用》真的是看不懂,最近开始看起了英文版的 Numerical Ecology with R,这一本是2018年再版的,比上一版确实实用了太多。所以打算将一些重要的笔记记录在此。 大家可以自己去下载他的数据,或者发邮件(2674102796@qq.com)找我要。 加载包,并读取数据。 library(Rgoogl ...
个人分类: 数据分析|1733 次阅读|没有评论
用R语言计算植物群落的重要值 (IV, Important Value)
热度 3 王庚申 2019-6-10 20:02
假期前往了几个自然保护区做植物调查,拿到了不少植物群落的数据。之前都懒得写,最近老板突然让交一篇论文,大家都手忙脚乱的处理数据QWQ!之前学习R语言,还有处理遥感数据的时候都查了不少博客里的攻略,让项目顺利完成,但是这次就没有查到处理植物群落的攻略,想着自己的R语言也写了挺久了,索性自己写一下吧! 关于 ...
个人分类: 数据分析|5920 次阅读|4 个评论 热度 3
麋鹿分布图制作(二)—— 用Python和R在地图上打点
王庚申 2019-6-10 20:00
上期用Python调用百度API得到地点的经纬度, 今天就将这些点标注在地图上。 首先我们用R语言来标注。 文中用到的文件已上传到 Github 。 library ( rgdal ) library ( ggplot2 ) library ( mapproj ) library ( xlsx ) # 设置一下工作路径 setwd ...
个人分类: 数据分析|1958 次阅读|没有评论
麋鹿分布图制作(一)——调用百度API查询地名的坐标
王庚申 2019-6-10 19:57
最近在做保护生物学的论文,查论文的过程中发现之前的麋鹿分布图是手绘的,看起来真的是。。。,因此我决定重新画一下这个图。 这个地图的绘制我分为两个部分:(一)调用百度API查找地点的经纬度,(二)用python的basemap模块绘制分布图。 我手录了 麋鹿数据(点击下载) 。 在使用百度地图之前,我们需要先注册、申 ...
个人分类: 数据分析|1437 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-11-28 17:18

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部