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扩增子分析流程
2019-4-21 20:08
总目录 http://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__biz=MzUzMjA4Njc1MA==hid=4sn=85f768f81736c77cadb1952cb3dd8ff7scene=18#wechat_redirect QIIME的虚拟机安装 https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMjA4Njc1MA==mid=2247483675idx=1sn=ffa42b6f5dd32b867bae247021d8e975scene=19#wecha ...
个人分类: 生物统计软件|2096 次阅读|没有评论
qiime2系列
2019-4-12 20:38
QIIME 2:可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/85047894 QIIME 2用户文档. 1简介和安装(2018.11) https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/85047833 QIIME 2用户文档. 2插件工作流程概述(2018.11) ...
个人分类: 生物统计软件|1702 次阅读|没有评论
简并碱基符号对应表
2019-3-10 18:38
简并碱基符号对应表 简并碱基 含义 正常碱基 互补碱基 R puRine A/G Y Y pYrimidine C/T R M aMino A/C K K Keto G/T M S Strong G/C S W Weak A/T W B not A (B comes after A) G/T/C V V not T (V comes after T and U) G/A/C B D not C (D comes a ...
个人分类: 生物数据|6775 次阅读|没有评论
16S rRNA常用引物
2019-2-18 09:10
Primer name Sequence (5'-3') 8F AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG U1492R GGT TAC CTT GTT ACG ACT T 928F TAA AAC TYA AAK GAA TTG ACG GG 336R ACT GCT GCS YCC CGT AGG AGT CT 1100F YAA CGA GCG CAA CCC 1100R GGG TTG CGC TCG TTG 337F GAC TCC T ...
个人分类: 生物数据|4588 次阅读|没有评论
[转载]整理的相对全、较稳定谷歌镜像wiki镜像
2019-1-3 20:45
本人常用,长期稳定: https://kfd.me/ 不确定: https://e.aigg.men/ https://scholar.uulucky.com/ https://g.vvvip.top/ (无广告,体验良好) https://google.ywhyme.cf/ (无广告,体验良好) https://e.scmor.site/ (有广告,体验良好) https://mekak ...
个人分类: 常用软件|13003 次阅读|没有评论
R包ggplot2基础
2018-11-27 20:11
最近使用ggplot2绘图比较多,发现了一个很不错的介绍: R_ggplot2基础(一) https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA3MTM3NTA5Ng==mid=2651059327idx=1sn=ad8238c63071040f59668aed7e30f1f0chksm=84d9d5e8b3ae5cfede6b9c7fe6c4f4e16bed86570b2aaf262d29e8aa47d26247f026581a3771mpshare=1scene ...
个人分类: 常用软件|1445 次阅读|没有评论
virtualbox中多个虚拟机使用同一个虚拟系统文件vdi
2018-11-16 19:42
在安装virtualbox以后有时需要复制,移动虚拟硬盘等操作,这些操作在vmware虚拟机中直接操作就可以使用,但是在virtualbox环境中每个vdi都有一个唯一的uuid,所以复制的vdi文件是不可以直接拿来使用的。 若直接使用,会出现下面的错误: 我们需要使用到virtualbox自 ...
个人分类: 常用软件|4928 次阅读|没有评论
Ubuntu开机蓝屏问题
2018-11-16 14:47
最近一次虚拟机开机时蓝屏黑屏交替,输入登录密码后一片蓝,当时没有截图,借用网上的图片。搜索原因时说是之前暴力关机时导致图形系统配置错误。因为虚拟机里还有需要的文件,所以并不是很想重装,尝试了网上提供的方法,亲测有效。 在开机时首先进入命令行模式 很多教程里说“C ...
个人分类: 常用软件|5593 次阅读|没有评论
Striped UniFrac
2018-11-8 09:38
参考: https://www.nature.com/articles/s41592-018-0187-8#MOESM6 https://github.com/biocore/unifrac 这是一种更快速,占用内存更少的计算UniFrac距离矩阵的方法,支持unweighted UniFrac,weighted UniFrac, generalized UniFrac, variance adjusted weighted ...
个人分类: 生物统计软件|1867 次阅读|没有评论

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