wbb121的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/wbb121

博文

Striped UniFrac

已有 2531 次阅读 2018-11-8 09:38 |个人分类:生物统计软件|系统分类:科研笔记| UniFrac, QIIME

参考:https://www.nature.com/articles/s41592-018-0187-8#MOESM6

          https://github.com/biocore/unifrac


这是一种更快速,占用内存更少的计算UniFrac距离矩阵的方法,支持unweighted UniFrac, weighted UniFrac, generalized UniFrac, variance adjusted weighted UniFrac, 和meta UniFrac.


有多种方式来安装库,最常使用的是两种,一种是QIIME2,一种是pip。最简单的方式是QIIME2,默认安装此模块。


QIIME2的安装见https://docs.qiime2.org/2018.2/install/



(未完)



https://wap.sciencenet.cn/blog-3388297-1145144.html

上一篇:两个计算aligment-free距离矩阵的程序
下一篇:Ubuntu开机蓝屏问题
收藏 IP: 58.194.168.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-3-29 07:05

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部