woodcorpse的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/woodcorpse

博文

按标题搜索
QIIME 2教程. 10数据导出ExportingData(2020.11)
2021-1-24 22:05
QIIME 2用户文档. 10数据导出 https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/exporting/ Exporting data 注:最好按本教程顺序学习,想直接学习本章,至少完成本系列 1简介和安装 。 为了使用QIIME 2,输入数据必须存储在QIIME 2对象(即 qza 文件)中。这是支持分布式、自动来源跟踪、语义类型验证和数据格式之 ...
个人分类: QIIME2|682 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 13训练特征分类器Training feature classifiers(2020.11)
2021-1-24 22:04
训练特征分类器 Training feature classifiers with q2-feature-classifier https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/feature-classifier/ 注:最好按本教程顺序学习,想直接学习本章,至少完成本系列 1简介和安装 。 详者注:为什么要训练分类集? 因为不同实验的扩增区域不同,鉴定物种分类的精度不同,提 ...
个人分类: QIIME2|701 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 12数据筛选Filtering data(2020.11)
2021-1-24 20:48
QIIME 2用户文档. 12数据筛选 Filtering data https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/filtering/ 注:此实例需要完成本系列文章 《1简介和安装》 本教程介绍如何过滤QIIME 2中的特征表、序列和距离矩阵,软件将随着更新,新增可用的过滤功能,从而不断扩大其应用范围。 详者注:复杂的实验通常会有非常 ...
个人分类: QIIME2|568 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 11元数据Metadata(2020.11)
2021-1-24 19:37
QIIME 2用户文档. 11元数据 Metadata in QIIME 2 https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/metadata/ 注: 此实例需要一些基础知识,要求完成本系列文章前两篇内容: 《1简介和安装》 和 《4人体各部位微生物组分析》 。 详者注:什么是元数据?是描述数据的数据,样本信息是样本元数据,物种注释是特征元数 ...
个人分类: QIIME2|911 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 09数据导入Importing data(2020.11)
2021-1-15 22:43
QIIME 2用户文档. 9数据导入 Importing data 原文地址: https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/importing/ 为了使用QIIME 2,输入数据必须存储在 QIIME 2对象(即qza文件) 中。这是实现支持分布式和自动来源跟踪、以及语义类型验证和数据格式之间的转换所必须(有关QIIME 2对象的更多详细信息,请参阅 《1简 ...
个人分类: QIIME2|1153 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 08差异丰度分析gneiss(2020.11)
2021-1-15 22:23
QIIME 2用户文档. 8差异丰度分析gneiss Differential abundance analysis with gneiss 原文地址: https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/gneiss/ 此实例需要一些基础知识,要求完成本系列文章前两篇内容:《 1简介和安装IntroductionInstall 》和《 4人体各部位微生物组分析MovingPicture 》。 在本教 ...
个人分类: QIIME2|682 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 07Cell帕金森小鼠Parkinson\'s Mouse(2020.11,最佳实战)
2021-1-12 22:27
QIIME 2用户文档. 7帕金森小鼠教程 Parkinson’s Mouse Tutorial 原文地址: https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/pd-mice/ 本教程将使用来自 人源化(humanized)小鼠 的一组粪便样品,展示16S rRNA基因扩增子数据的“典型”QIIME 2分析。最初的研究, Sampson等,2016 旨在确定粪便微生物组是否有助于帕金森 ...
个人分类: QIIME2|919 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 06沙漠土壤分析AtacamaSoil(2020.11)
2021-1-12 18:54
QIIME 2用户文档. 6阿塔卡马沙漠微生物组分析 原文地址: https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/atacama-soils/ 此实例需要一些基础知识,要求完成本系列文章前两篇内容:《 1简介和安装IntroductionInstall 》和《 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 》。 本教程设计用于两个目的。 首先,它描 ...
个人分类: QIIME2|662 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 05粪菌移植分析练习(FMT)(2020.11)
2020-12-28 20:22
QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习 Fecal microbiota transplant (FMT) study: an exercise https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/fmt/ 注意:本教程假定您已经完成 1简介和安装IntroductionInstall ,成功安装QIIME 2。 本教程计划在完成《 4人体各部位微生物组分析MovingPicture 》之后练习。它旨 ...
个人分类: QIIME2|858 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 04人体微生物组分析Moving Pictures(2020.11)
2020-12-28 20:21
QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组 “Moving Pictures” tutorial https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/moving-pictures/ 本节1.6万字,14张图,3个视频。阅读时间大约40分钟。 注意:本文学习需要安装好QIIME 2,请务必完成 1简介和安装IntroductionInstall 在本教程中,你将使用QIIME 2在五 ...
个人分类: QIIME2|1174 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-10-24 10:20

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部