R语言统计入门课程推荐——生物科学中的数据分析

刘永鑫 2018-8-31 00:12

Data Analysis for the Life Sciences是哈佛大学PH525x系列课程——生物医学中的数据分析(PH525x series - Biomedical Data Science )，课程全部采用R语言进行统计分析理论教学与实战。教材采用Rmarkdown语言编写，易轻松易读，又保证分析的可重复性，代表了科学界最先进的可重复计算要求，我们不仅可以系统学习一个 ...

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宏基因组理论教程2扩增子分析

刘永鑫 2018-8-24 20:53

之前分享的加拿大生信网出品的 《宏基因组分析教程》 ，有1万多位朋友阅读，有近2000多小伙伴下载了课程PPT。 但不知有多少小伙伴真正仔细学习过。 收藏是没有用的，只有真正多学几遍才有收获 。 对于英文原版教程，很多 新人有看不懂，学不会的问题 。宏基因组团队针对这套教程进了翻译，同时结合最近的研究进展对内容 ...

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宏基因组理论教程1宏基因组简介

刘永鑫 2018-8-23 22:33

之前分享的加拿大生信网出品的 《宏基因组分析教程》 ，有1万多位朋友阅读，有近2000多小伙伴下载了课程PPT。 但不知有多少小伙伴真正仔细学习过。 收藏是没有用的，只有真正多学几遍才有收获 。 对于英文原版教程，很多 新人有看不懂，学不会的问题 。宏基因组团队针对这套教程进了翻译，同时结合最近的研究进展对内容 ...

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微生物组——扩增子分析专题研讨会-9月-北京！！！

刘永鑫 2018-7-27 13:12

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在 2018年9月14-16日北京鼓楼 推出《 扩增子有参无参分析和功能预测 》专题培训第二期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集 ...

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基础001.Markdown编写云笔记

刘永鑫 2018-7-19 13:58

笔记的重要性： 笔记是个人能力提高和知识体系积累的关键性习惯！ 学习前准备： 安装有道云笔记记录个人笔记 安装有道云协作共享精华笔记、多人协作 FSCapture截图 安装Filezilla上传图片 拥有公网服务器存储图片(或gituhub，图床七牛云等) 笔记的记录方式 常见的笔记记录方式有三种，其实也是我个 ...

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生信暑期黑马集训

刘永鑫 2018-7-9 20:27

开课背景 生物信息学说起来很好理解，可是对大部分想学习生信的人来说，操作起来却是有些棘手，无有头绪。生信的研究内容主要包括两个方面：首先，需要生物研究者利用实验收集、整理、储存、获取生物学数据；另一方面，需要依托数理信息科学的技术和方法管理和分析数据。如今工具开发者（IT）和工具应用者（Biologist） ...

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学术论文模式图、统计图绘制

刘永鑫 2018-7-9 20:24

开课背景 我们经常在文献中看到非常漂亮的插图，相信你也曾和我一样想过：这样的插图是怎样制作出来的呢？我能不能也制作出这样的插图呢？其实，插图制作这项技能并非“高深莫测”，它在国外已经非常普及，我们可以看到大部分国外实验室的文章都配有非常精美的插图。但是由于国内科研工作者对插图的不够重视，目前它在国 ...

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易生信-扩增子教程02-真菌引物选择

刘永鑫 2018-6-29 22:03

距离上次《生信宝典》联合《宏基因组》组织的扩增子分析线下培训结束己经有三个多月了。为方便广大读者的学习，现在开始陆续分享上次培训的内部资料——理论课程课件。希望对想自学分析的朋友起到一定帮助作用。 首先讲一下真菌的定义，真菌通常指的是真菌界的生物，是一类单细胞或多细胞异养真核微生物,无光合色素 ...

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微生物组助手——最易学的扩增子、宏基因组分析流程

刘永鑫 2018-5-20 22:57

软件简介 Microbiome Helper开源软件，方便大家分析微生物组数据。不仅提供了多套扩增子、宏基因组的分析流程方案，同时提供了几十个软件间衔接的脚本，可大大提高使用者分析的效率。 文章于2017年发表于mSystems。Github项目主页： https://github.com/LangilleLab/microbiome_helper microbiome help结合不同组 ...

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