QIIME 2用户文档. 9数据导出Exporting data(2018.11)

刘永鑫 2019-1-3 12:28

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 5粪菌移植分析练习 5粪菌移植分析练习 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入 QIIME 2用户文档. ...

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QIIME 2用户文档. 8数据导入Importing data(2018.11)

刘永鑫 2019-1-2 10:45

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 5粪菌移植分析练习 5粪菌移植分析练习 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss QIIME 2用户文档. 8数据导入 Imp ...

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QIIME 2用户文档. 7差异丰度分析gneiss(2018.11)

刘永鑫 2019-1-1 09:22

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 5粪菌移植分析练习 5粪菌移植分析练习 6沙漠土壤分析Atacama soil QIIME 2用户文档. 7差异丰度分析gneiss Differential ab ...

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QIIME 2用户文档. 6沙漠土壤分析Atacama soil(2018.11)

刘永鑫 2018-12-29 21:17

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 5粪菌移植分析练习 QIIME 2用户文档. 6阿塔卡马沙漠微生物组分析 原文地址： https://docs.qiime2.org/2018.11/tutorials/atacama-so ...

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QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习Fecal microbiota transplant (FMT) stud

刘永鑫 2018-12-26 11:18

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习 Fecal microbiota transplant (FMT) study: an exercise https://docs.qiime2.org/2018.11/tutorials/fmt/ ...

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QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组分析实战Moving Pictures(2018.11)

刘永鑫 2018-12-25 21:05

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组 “Moving Pictures” tutorial https://docs.qiime2.org/2018.11/tutorials/moving-pictures/ 注意：本文学习需要安装好QIIME 2，请务 ...

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QIIME 2用户文档. 3老司机上路指南(2018.11)

刘永鑫 2018-12-22 00:11

前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 老司机上路指南 QIIME 2 for Experienced Microbiome Researchers 本节5365字，我们将介绍如何使用QIIME 2处理微生物数据。本节教程主要针对经验丰富的微生物研究人员，即已经对如何处理数据非常 ...

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QIIME 2：可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程

刘永鑫 2018-12-17 13:08

2010年发表于Nature Methods的QIIME 是微生物组领域最广泛使用的扩增子数据分析流程，截止2018年12月16日，Google Scholar统计引用 13,126 次。随着近年来测序通量的提高，大规模研究开展，其软件架构己法满足当前微生物组可重复分析的要求。 为满足当前大数据、可重复分析的需求，由QIIME第一作者Gregory Caporaso领 ...

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QIIME 2用户文档. 1简介和安装(2018.11)

刘永鑫 2018-12-17 13:01

写在前面 QIIME是微生物组领域最广泛使用的分析流程，8年引超1.3万次。为满足当前大数据、可重复分析的需求，Gregory Caporaso教授于2016年从头开发了QIIME 2，并获得了来自全世界70多家单位的100多名同行参与，于2018年全面接档QIIME。 宏基因组团队于2017年6月加入了项目的测试和教程编写，并负责中文文档的翻译和 ...

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