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PICRUSt2分析实战:16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组、新增KEGG层级
热度 1 2021-7-8 22:27
PICRUSt2分析实战:16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组、新增KEGG层级 更新时间:2021年7月8日 PICRUSt推出了近8年,引用5000余次。 现推出PICRUSt2,202年再次霸气发表于顶级期刊Nature Biotechnology,原文解读详见: NBT:PICRUSt2预测宏基因组功能 主页: https://github.com/picrust/picrust2 具有以下 ...
个人分类: 扩增子|866 次阅读|2 个评论 热度 1
微生物组-扩增子16S分析第12期(报名直播课免费参加线下2021.7)
2021-4-13 18:40
在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在 2021年7月23-25日北京 推出《 扩增子16S分析 》专题培训第10期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子分析实战学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+集中讲解答疑+上课视频回 ...
个人分类: 扩增子|412 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 27语义类型Semantic(2020.11)
2021-2-4 23:03
语义类型 Semantic types https://docs.qiime2.org/2020.11/semantic-types 所有的QIIME 2的对象(documentation)都定义了语义类型。此文介绍了如何使用这些语义类型,如何在QIIME 2插件中定义新的语义类型。 为什么定义语义类型 Why define semantic types? 定义语义类型可以帮助我们确保被传递到某个动作 ...
个人分类: 扩增子|376 次阅读|没有评论
NatureProtocols:使用MicrobiomeAnalyst统计和功能分析微生物组数据
2020-3-23 21:10
使用MicrobiomeAnalyst进行微生物组数据的全面统计、功能和元分析 Using MicrobiomeAnalyst for comprehensive statistical, functional, and meta-analysis of microbiome data Nature Protocols Impact Factor 11.334 https://doi.org/10.1038/s41596-019-0264-1 发表日期:2020-01-15 第一作者:Jas ...
个人分类: 扩增子|6099 次阅读|没有评论
NBT:扩增子及其他测序的最小信息标准和测序规范(MIMARKS)
2020-2-12 19:34
扩增子测序的最小信息标准和测序规范 Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications 译者:文涛 南京农业大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 Nature Biotechnology 2011-05-06 Articles doi: https://doi ...
个人分类: 扩增子|1005 次阅读|没有评论
USEARCH —— 最简单易学的扩增子分析流程
2019-7-29 17:08
USEARCH —— 最简单易学的扩增子分析流程 USEARCH中文帮助文档(USEARCH Chinese manual) USEARCH官方英文主页: http://www.drive5.com/usearch/ 本站经USEARCH作者Robert Edgar授权,由《宏基因组》公众号翻译的中文帮助文档和系列教程。 USEARCH简介 USEARCH是最好用的扩增子分析流程,在体积仅1 MB的软件中 ...
个人分类: 扩增子|2883 次阅读|没有评论
NAR:MicrobiomeAnalyst微生物组分析师——统计、可视化和元分析微生物组数据的网页工具
2018-11-20 21:59
微生物组分析师:统计、可视和元分析微生物组数据的网页工具 MicrobiomeAnalyst — comprehensive statistical, visual and meta-analysis of microbiome data 第一作者:Achal Dhariwal 通讯作者:夏建国 Jianguo Xia 主要单位:加拿大魁北克,麦吉尔大学,动物科学系,寄生虫研究所,微生物与免疫系,微生物 ...
个人分类: 扩增子|7518 次阅读|没有评论
2019微生物组——扩增子16S分析和功能预测专题培训开课啦!
2018-11-19 20:57
在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在 2019年1月11-13日北京鼓楼 推出《 扩增子有参无参分析和功能预测 》专题培训第二期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集 ...
个人分类: 扩增子|1895 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2021-10-24 11:17

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