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Sihu01 2019-10-21 22:51
王老师您好,学生看到一段话“ 豢龙氏 发表于 2019-1-8 16:19 你的水平就是用单一遗传标记来判断两个人群的整体遗传距离吗?如果是这样我觉得也没什么好说的了。 不是单一标记,而是说,在综合证据年前,面对复杂的古代种系混血历史,mixtree用基因频度做简单的系统发育树,根本没什么大的参考价值。如下复杂的历史,mixtree是无能为力的。 在线粒体和YDNA等任何清晰谱系树下的证据面前,都没有证据表明澳大利亚人种与蒙古人种关系比高加索人种更近,treemix用基因频度做出的谱系树当然没有任何可信度。” http://www.ranha ... ...
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[转载]利用PLINK进行GWAS分析 2018-12-01
利用PLINK进行GWAS分析(五) Apr 10, 2015 这一篇正式介绍全基因组关联分析的PLINK的commands。</br> #case-control 试验设计 对绵羊的有角和无角这 ...
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全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)流程 全基因组关联分析流程: 一、准备plink文件 1、准备PE ...
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GWAS | 全基因组关联分析 | PLINK | 实战 | 统计遗传学 转载自http://www.cnblogs.com/leezx/p/9013615.html
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对基因组序列进行模拟酶切(电子酶切)的Perl包(module) 2017-03-20
GBS或者RAD技术可简化基因组序列,在群体基因型鉴定、进化分析中应用广泛。而选择合适的限制性内切酶是此技术的关键步骤。Perl模块RestrictionDigest是一款功 ...
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使用Plink将VCF转换为Treemix所需文件 2017-03-20
材料介绍:11个地点的132个个体重测序,获得VCF格式数据,通过Treemix推测迁移事件。 1、使用vcftools将VCF文件转换成.ped(此格式丢失了数据,我换用了.tp ...
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