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你发表第一篇SCI论文经历了怎样的过程?

已有 611 次阅读 2020-7-27 09:29 |个人分类:论文写作|系统分类:论文交流| 论文润色、经验分享

投叔读博时发的第一篇SCI论文,刚好是本人以第一作者身份发表的第一篇SCI论文——读硕期间发表过一篇SCI论文,但并不是一作。

先提前剧透一下,这篇论文最后没能进入投叔博士论文的正文中,仅仅是在publication中列了一下。

说到这里,懂行的人应该已经猜到了。这篇论文其实做的是一个比较简单的,所谓副课题,也就是side project。也正是因为这个定位,我没能完成后续的一系列研究。

好吧,现在从头讲一下这个论文发表的经过。

刚开始读博,投叔大概用了两三个月的时间来warm up。具体地,是给兄弟组做几个化合物,完成一个合作项目。在这期间,除了做实验之外,还查文献整理文献,最终确定了主课题:从此我悲催的博士生涯开始了,当然,这是另一个故事。

主课题很快遭遇不顺,目标分子的一个关键片段被人抢先报道。

当时我很疑惑,甚至产生了“红旗到底能扛多久”的怀疑。后来跟导师仔细研究了一下已经发表的方法,觉得我们能做得更加elegant,所以还是决定把课题推下去。于是不幸接踵而至,不久又遇到了瓶颈。

遇到瓶颈,除了反复试验之外,肯定还是需要继续读文献,找方法。一次很偶然的机会,在组会的头脑风暴时,聊到了一个新方法。虽然这个新方法最后没有应用在解决主课题的问题上,但我们都觉得很有价值,就这样确定了side project。

Side project是一个多组分反应,最终可以高效地合成异吲哚。我跟导师还有组里的博后反复琢磨机理,觉得还是走得通的,也值得开发成一个新的有机合成方法。就这样,在我解决主课题的空余时间,开始了方法学研究。每天挂很多小瓶子,不停地筛选条件。

实验科学里,机理能走通跟实验能做出来,完全是两码事。

在进行side project的研究中,我也碰到了非常多的新问题,最关键的一点是产率上不来。后来柳暗花明,从一个很偏门的反应中,一篇很偏门的文献中得到灵感,找到一个无机盐做反应助剂,产率一下子就上来了。而且最终开发的体系是水和DMSO的混合溶剂,这样可以用氘代水和氘代DMSO做实验,顺手研究了一下反应的机理。

等到体系开发完毕后,导师就把最早一块儿提想法的那个博后加进来,因为本来也有他的想法,要挂他名字,不如直接让他做点事;另外还加了一个人,是我同一级的同学,刚好也是主课题做得很郁闷,加进来找找自信。

我们三个人,一起拓展底物,前后得到20多个从未见报道的新化合物。但直到这时,我们仍然不知道这样凭空做出来的东西有什么用。

非常巧,在那段时间,OL的副主编,法国的一位女化学家到我们学校开讲座。在她的ppt里,出现了好几次异吲哚结构。我很感兴趣,讲座完后跟她交流了一下,提到了接近收尾的这个side project。她很感兴趣,建议我们投OL。

这让我们挺意外的。本来我们几个人觉得手里就是个小玩意儿,大概发个一两分文章得了。但这个女化学家很识货,因为她知道,异吲哚非常不稳定,合成难度比较大。

说到这里,可以讲一点题外话。吲哚很常见,氨基酸中的色氨酸就有吲哚,粪便中还有3-甲基吲哚。但吲哚一旦变成异吲哚,就很不稳定了。这大概也能解释为什么大自然在进化中选择了吲哚而不是异吲哚。

知道能发OL了,我们几个人鼓起干劲儿,把课题快快收尾。完成后,大家想着怎么也得给这些新化合物找点所谓的“用处”吧。在合成中,我们发现这东西有很强的荧光,就先把荧光数据测了,准备在文章里朝这个方向包装。

后来导师建议说最好弄个纯合成吧,我们就商量了一下,把异吲哚作为DA反应的双烯体,做了一系列DA反应,又拿到一组新化合物。数据收集齐全,就投给OL了。

文章投出去后很快就被接受,只有小修改,我们花一个通宵把小修改搞定就定稿了。论文投出去到online,只用了两周,正式出版也才三周。

这篇论文的全部过程到这里也差不多讲完,总体很顺利,前后花了小半年的时间。文章发出来的时候,大家都挺高兴。因为在当时,这还是我们课题组最好的文章之一。在投叔的这篇OL之前,课题组最好的文章也是一篇OL。后来我们课题组发展得非常好,OL就可有可无了。

非常可惜的是,当时没有对荧光特性进行更深的研究,我的工作重心就又回到主课题上。我们组后面有个小伙子,拿这个方法点亮一些蛋白和细胞,发了几篇CC。

好了,总结一下课题从设计到发论文的整个过程,看看得到了什么经验。

首先是一定要想明白原理即便在实验性学科里,原理也是无比重要的,先把原理走通,前途一定是光明的。

第二,不停地查文献读文献。即便前途光明,中间也会有波折。具体问题的解决,多数时候并不是靠灵光一现的所谓天才想法,而是靠广泛地阅读文献,甚至要阅读跟课题看上去毫无联系的文献。

第三,课题完成后,还是要仔细查文献读文献,看看自己手里的东西到底怎么样。很多时候,面对新事物,一般人无法评估。多查查文献,多请教一下行内的专家,这样才能更准确地给自己的成果找到定位,进而选择合适的期刊投稿。

第四,在实验过程中就把数据收集好,做扎实。投稿的时候,一次性写好,不要等审稿人提了,才去补。数据扎扎实实,会给审稿人一个好印象,增加过稿的可能性。那到底需要做哪些数据呢?很简单,看看目标期刊以往的论文,都列了哪些数据,不要偷懒,老老实实把数据都收了,还特别要注意期刊对数据质量的要求。手里比较差的数据,多重复做几遍,不要怕麻烦。

投叔的博士生涯非常悲催,可能唯一算得上顺利的,就是这个side project了。现在把经过记录下来,希望能对后来人有所帮助。

投叔经常感慨,一代更比一代强。投叔那年代,完全是两眼一抹黑地瞎搞,现在就好啦,有“投必得”这样的专业机构为大家服务,论文润色完,还给出投稿建议。

投叔真的好羡慕啊~~


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