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论学术争论 – 生物学与计算机

已有 1663 次阅读 2015-2-4 11:27 |个人分类:杂谈|系统分类:科普集锦| 科学, 概念, 方法, 原理

关于学术争论是正常现象,1999-2001L.Hood的“系统生物学”概念,在国际上就有以百篇计数的论文争论,原因:胡德没有引用“系统生物学”术语的来源 - 美国MD. Mesarovic1968年在“系统论与生物学”会议提出(当时实际为理论生物学概念),2003年和2005年获奖(http://en.wikipedia.org/wiki/Mihajlo_D._Mesarovic),同时,没有阐述清楚胡德的概念是Omics组学的实验方法,以及与贝塔朗菲的系统论方法研究生物系统的理论生物学概念的相同与不同,也没有阐述清楚“生物系统”概念,而且,1999-2001H.Kitano的“系统生物学”概念,则是计算生物学或In Silico计算机模拟的概念,目前,国际上共识的系统生物学概念 理论和实验、计算生物学方法的生物系统研究,也就是1996-1999BJ.Zeng在国际上倡导的概念。

因为,“透明计算”和“云计算”(2009年同仁与我讨论过)与医学的远程数据系统等存在应用关系,术语和概念是构建学科理论体系的基石;所以,参与了有关“透明计算”等概念的评论。其中,关键是阐述清楚相关概念(http://en.wikipedia.org/wiki/Transparent_computinghttp://en.wikipedia.org/wiki/Cloud_computing)的相同与不同,以及继承与发展的过程等。关于“透明计算”的术语来源,以及与诺伊曼模型的关系,答疑的解释应该比较清楚(http://blog.sciencenet.cn/blog-865037-862953.html1)“透明计算”是2003年左右微软起的名字2)扩展了冯·诺依曼结构等,至于具体有关计算机技术、设计方案和软件等,不属于我的专业知识范畴,就不加以评述。关于其它领域,如,传统文化与科学历史、社会体制与意识形态等,也应该参考国际科学的学术辩论或交流的探讨模式。

附、学术繁荣与科学进步

建国初期,学贯东西文化的哲学家(如,新儒家)、艺术家(如,徐悲鸿)和科学家等,开创了中国文化和科学的现代化路径;然而,20世纪60年代-70年代产生了一个断层,而后,80年代-90年代重新形成创新发展的时期。

在学术上,常常会产生横空出世的感觉或分别独立提出的现象,其实,很多情况下是以其它途径发生了影响,如:

20世纪90年代论述系统生物工程等,引用了贝塔郎菲、汤普森和B.Mandelbrot等著作和R.Rosen等论文(并上载在1999年的英文网站 - 包括,组学和生物技术、计算和生物信息学等资讯),并没有读到系统生物学合成生物学等术语,却恰好汤普森的著作引用了合成生物学术语,而R.Rosen参与了《系统论与生物学》论文集的编辑等。

人类文化的继承与发展,文化的交汇,往往是产生创造发明的环境;因而,学术和科学的进步,往往是继承与发展的关系。

注:1992年在中国的中西医学比较和中医药现代化的过程提出系统医学,2003S.Benner提出个体化医学和FM.Marincola提出转化医学等概念。

-(评述总结)-



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