自1983年到2013年的思考，可概括为科学的哲学、历史和社会学等，包括，科学与宗教-艺术、科学与工业-经济等关系的研究与探索。

16世纪之后，人类文明进入科学文化模式，包括，法学与管理学等社会科学。

近现代科学方法奠基，以达芬奇的工程设计、韦达数学方程和培根归纳逻辑、笛卡尔的演绎逻辑为起点。科学是复合概念，包括，逻辑思维、数学方法和工程技术等构成，系统和综合思维方法，开始于莱布尼兹和康德哲学等。

比如，

数学符号 – 韦达和莱布尼兹等发明；

光学仪器 – 伽利略、开普勒的望远镜和胡克的显微镜等；

实验技术 – 波义耳化学的实验等；

数学方法 – 牛顿、莱布尼兹微积分等；

理论思维 – 康德星云假说、多普勒效应和菲涅耳光学理论等。

再如，

开普勒的光度距离平方反比律与牛顿万有引力定律，小孔成像的杨氏干涉实验与X线晶体衍射的劳厄方程等；

伽利略的惯性定律与爱因斯坦的理想实验方法等。

20世纪，数学模型、计算机软件和物理-化学技术、工程设计等方法建立，实验与系统科学的体系形成。系统方法是分析与综合渗透的方法，包括，解析、转换与建构等逻辑过程的思维方法。

人类轴心时代，文化进入中国诸子百家 – 哲学和工程技术、艺术等分科发展时期，禅宗是道-释家融合的方法论。欧洲中世纪以基督教-希腊哲学为模式，近现代转换为儒学模式的伦理诠释和科学-艺术方法与工业化发展。

地理发现以来，5百年全球化文明，就是在综合古代东西方文化和体制上的社会转型，建立近现代科学与工业文明模式。

附：

系统遗传学 – 细胞机器设计原理

Systems Genetics - The Designing Principles of Cell Machine

1、结构论 – 生物系统与人工生物系统理论。

2、系统生物学 – 理论与实验、计算与工程方法，包括，实验生物技术和计算机软件技术等。

3、系统遗传学 – 复杂生物系统机理 – 分子网络结构和程序运行功能的细胞设计，包括，膜蛋白、酶复合体、核糖体等分子系统，基因调控网络、信号传导路径和代谢反应链等构成精巧的细胞分子机器。

4、系统生物工程 – 合成生物学，人工生物系统的基因设计与合成。

5、系统医学与药物学 – 医学模型，细胞发生动力学 – 细胞进化与发育、病理等，细胞抗药机理，肿瘤疾病的遗传分析与药物筛选、工程医学等。

-（1983年-2013年）-