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实验与计算生物学

已有 1988 次阅读 2013-9-25 20:42 |个人分类:V3|系统分类:科普集锦| 系统生物学, 整合, 实验与计算

- 系统医学意在何处?(3

个性化医学词汇出现在S.Benner2003年论文中,但他的主要论述是合成生物学和人工生物学,系统医药学(systems medicine and pharmacology)词汇和概念是1992年在中国提出,不同于系统生物医学在于基础与临床医学的结合,或重心在医疗实践,之后,约2008年美国建立系统医学研究所。

胡德最早记录用到系统生物学词汇是199910月,用到个性化医学为2004年,系统生物学与4P医学阐述的是组学(omics)和分子和纳米生物技术的生物学与医学研究,包括,生物标志(biomarkers)诊断分析等,或称“技术生物学”(technological biology)或技术系统生物学。

胡德定义的系统所有分子(基因、RNA和蛋白质)及相互作用的研究概念,导致大量国际学术争论,也是导致许多生物化学家、分子生物学家和生理学家等声称己做了半个世纪系统生物学研究的起因;因为,生物学研究,不可能不涉及相互作用的研究,基因表达、代谢反应过程都是,多学科观点也基本是生物仪器的技术研究涵义,论述的也是组学的生物实验和数据的计算机软件分析。

实际上,1996-1999年以来我倡导的是实验生物学 - 包括,组学(omics)、转基因生物技术等,和计算生物学 包括,生物信息学、计算机辅助设计等,整合起来的生物系统,包括,分子、细胞和器官、个体、生态等层次的研究。

200112Arkin AP.论述的是合成细胞生物学和工程方法的计算机辅助设计方法,而H.Kitano2000年国际会议以来论述的核心是计算系统生物学,或M.Tomita的计算(in silico)生物学模拟(simulation)细胞分子相互作用的e-cell等软件设计与分析方法。

-V3系统生物学 将系列评述系统生物学人物的观点)-



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1 许培扬

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