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系统医学 - 拓扑网络学

已有 1087 次阅读 2012-10-22 13:48 |个人分类:2012|系统分类:教学心得| 医学, 拓扑, 图论

我的出生地是湖南古台山林场,父亲从城里来到那里创建,种植药材。儿时,我在屋前石拱桥下的小溪里是抓螃蟹,在屋后欣赏那些美丽的芍药花;因此,首先接触的是中药,后来因教生药学和药用植物学时来到南京药科大学,参加了到狼牙山采集药材的实习。

然而,自中学、大学到任教,读得最多的书籍还是科学史与哲学、心理学与医学等,比如,炼金术士罗吉尔·培根的光学和化学实验方法,博物学家林耐的生物分类学,以及托马斯·杨的光干涉实验和菲涅耳的光衍射理论、声波的多普勒效应等,精神分析学和格式达心理学等,而后,彭加勒的实在论和胡塞尔的现象学等。中药炼制实验和本草纲要的分类学等,在近代实验方法和生物学系统学(systematics)中的贡献是什么?这需要科学史学家深入研究;但是,无疑欧洲近现代科学、哲学、艺术乃至体制的建立,其中,不少源自对中国古代文化与体制的研究。

直接的也许就是系统医学提出,起初研究动物形态发生与环境相互关系,而后思考拓扑生物学,那时,刚阅读中医的理论书籍,也阅读数学的图论和拓扑学,猛然间发现:一是西医解剖学的器官恰好可以与中医理论的脏象对应,余下的就是经络系统对应神经-内分泌、免疫系统;二是四色定理可等价于四面体,金刚石的晶体结构以顶点的连线(connection)关系等恰好是阴阳五行图的联结模式;三是生理学的内分泌细胞甾体激素调控基因表达和神经-内分泌网络等,于是,代谢系统的控制论节律稳态和发育系统的基因与神经协调变化和分子-细胞、器官-个体、种群-生态的生物系统层次的清晰模型出现 – 1992年获得湘潭市医学科技先进工作者奖,并评上讲师;但是,1999年我放在互联网上时却为国外一物理学家链接在他的超弦(string theory)网页上。

1994年到了北京中关村,生物发育、细胞分化的mRNA差异显示分析和核移植、转基因等,基因群与蛋白质系统对应关系 - 即,现在所谓之组学(omics)的研究及其调控的系统遗传学,转换到细胞信号传导与基因调控、细胞代谢系统的层次,以及基因组自组织化与程序化特异表达的系统研究,传感器与反应器的系统生物工程开发等。

 

参见“Network topology”(http://biomatics.org/index.php/Systems_Bioengineering)。

续,系统医学 - 回忆录(http://blog.sciencenet.cn/blog-286952-624743.html

附,分子与系统医学发展的关系:



http://wap.sciencenet.cn/blog-286952-625064.html

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3 许培扬 武夷山 黄智生

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