人类理性的曙光 – 指的是脱离野蛮和文明形态的诞生，这就是约公元前500年左右形成的希腊、犹太（波斯时期犹太教）、印度（尼泊尔时期佛教）和华夏文化模式。

约公元后500年中国“儒释道”3教9流的文明繁荣与发达，约公元后1500年欧洲进入近现代百科全书与科学发展时期。

从“儒释道”文化分立到政教分离、市场经济，知识、虚拟与制造经济的机制形成。

近代实验科学开始建立于古代经验和观察科学 – 师徒与作坊体制，僧侣的学术传统与工匠的技术传统结合诞生了科学的传统 – 学院与工厂体制，体现在科学实验室的教授（PI）、实验室（技术员）和研究生建制。

科学研究范式，向物理、化学、生物乃至经济学等领域渗透，向大学和工业转移，在德国建立了研究型大学模式，在美国建立了工业实验室模式等。

现代系统科学的发展，理论科学与实验科学的再度整合，于是在生物科学领域形成系统生物学的研究范式 – 建立的是科学实验室的教授（PI）、实验员（生物技术等）、IT工程师（计算机软件和数据库等）和研究生建制。

注，学习系统生物学的入门方法：
Google检索“systems biology”等进入国外研究机构网站（如，http://www.bsse.ethz.ch），下载一些课题组pulications中的论文阅读。

以1999年为界限，系统与合成生物学定义 - 理论（theoretical）和实验（experimental）、计算（computational）与工程（engineering）方法的生物系统与人工生物系统研究。