第一期，        贝塔朗菲的一般系统论和论述系统论和整体方法乃至计算机方法的生物系统研究，但是用的是有机生物学、有机心理学和理论生物学等词汇；同期有其他科学家提出系统心理学和系统生物学的词汇，但分别是工业心理学和工业技术科学家提出，也几乎没有多大影响。

第二期，        这是系统生态学和生物数学、系统生理学和生物控制论等，主要是属于生态系统、器官系统的研究；同时，生物化学、生物物理学领域的系统理论研究，比如非平衡热物理学、分子动力学等，以及生物化学的分子超循环理论、代谢反应的系统理论和计算机数学建模等，但也因为基本是理论生物学的研究路径，也走向了一个发展瓶颈。

第三期，        这应该是，至少从目前所检索的国内外文献来看，是起源于中国的中医药系统理论探讨和中医药现代化的生物物理学和生物技术的研究，这里走向一个分歧是全息生物学和全息医学，当时国内外影响都很大，但最终没有成为国际学术界接纳和发展的学科，我个人的出发点是结合了第一期和第二期，同时，包括这个背景而提出理论与实验结合的研究* - 并且是从细胞信号传导、基因调控网络到细胞发生动力学的概念。

现代系统生物学与系统生物工程（合成生物学）的系统论和实验、计算与工程方法结合的生物系统与人工生物系统概念（Zeng），最终是在中科院国内最早的分子生物技术、生物信息技术和转基因生物技术中心，也是中国微电子、计算机、自动化和人工智能等研究中心的中关村形成，并从1996年北京到1999年德国开始规模化的国际通讯和筹备国际协会与会议等。