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世纪之交的系统生物学革命

已有 1906 次阅读 2012-2-15 14:37 |个人分类:2012|系统分类:海外观察| 系统生物学, 科学革命, 21世纪

胡德说到“记不得”可能在1993年(2000年重版)他编的《Code of Code》用到“systems biology”一词,我检索不到这个词,倒是有一段涉及Biosystem但他的观点是还原论的individual基因和碱基序列。
北野宏明2001年出版的2000年会议论文集中提到他1998年在美国Caltech一次讲座首次用到“systems biology”,提到系统水平的研究在40-60年代控制论、系统论和30年坎农的生理稳态已经有,在分子水平研究则是首次;然而,我在80-90年代读到“systems ecology“等和Pub-Med检索到1993年已经有"systems biology"这个词汇,70年代艾根的分子超循环理论已经是分子层次的研究,80年代国际上生物化学系统论也是。

我则是80-90年代从理论生物学、新老三论(尤其生物信息进化的超循环理论)和中医药(尤其子午流注和经络的神经、内分泌、免疫和血液调控理论)现代化与中西医学比较研究,以及分子生物技术和生物信息技术、基因检索、同源分析、全基因合成等结合起来提出实验与理论、分析与综合结合的现代系统生物科学(医学、遗传学等)与工程概念、体系和观点。组织1996年国际转基因动物学术研讨会在大量国际email邮件和大会讲演中阐述,1999年春夏在德国大规模国际通信和建立网站(定义系统论和实验、计算与工程方法的生物系统与人工生物系统研究及微电子与转基因技术整合的细胞分子线路概念图) - 在国际刊物和媒体发布筹备会议和协会信息是直接的推动力。在1996年、1999年筹备会议等(关键时期)直接与胡德、北野宏明课题组有通信而2002年与挪威、2004年与澳大利亚等有直接的遗传学概念通信。

另,合成生物学是系统生物学的基因工程 – 系统生物工程的人工生物系统研究概念。

 

世纪之交 - 系统生物学的起因,80年代国内的中医药现代化研究和系统科学、科学哲学讨论热潮,先是从心身医学、行为医学和中西医学比较研究提出系统医药学,然后是系统生物工程和系统遗传学,90年代未中关村的计算机科学、微电子学和分子生物技术、生物信息技术及互联网兴起时期,一是导致了系统科学与分子生物学、计算机技术的结合,二是导致了国际email通信和生物信息数据库检索等。以1991年到1996年我在国内的研究为国际最早,其次是日本北野宏明1998年的加州讲座,其三是1997年我到国外和1999年到2001年的持续和规模国际通信、互联网媒体和国际刊物的刊登(1998年底建网站、1999年10月Nature发布),其四是胡德1999年10月注册系统生物学域名、北野宏明2000年11年举办国际会议和胡德成立研究所,其五是2003年国际上形成系统论和实验、计算方法结合研究生物系统的系统生物学概念和合成生物学是系统生物学的人工生物系统工程概念的共识。

 

-- 参见:“21世纪的生命科学新趋势 - 系统生物学”(http://wenku.baidu.com/view/06e5597202768e9951e738ec.html)--



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