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Crystal Orbital Hamiltonian Population Analysis

已有 4047 次阅读 2020-11-30 23:07 |系统分类:科研笔记

分析化学成键特性(COHP)的两个软件

Program1Lobster http://www.cohp.de/

Lobster可以视为一后处理软件,它是基于(VASP计算得到的)波函数文件进行处理的。采用VASP计算时,该软件要求采用全K点进行计算(即要求设置ISYM=-1,所得K点的权重均为1)。另外,该软件对赝势有要求,比如不得使用_sv的赝势。要分析的原子/离子对通过输入文件lobsterin进行设置,有指定原子和指定距离设置两种形式。具体要求和计算流程详见手册。

Lobsterin例子:

COHPstartEnergy  -8   !能量起始值

COHPendEnergy   12   !能量终止值。这两个参数定义能量范围,通常通过DOS判断

includeOrbitals s p   !价电子的轨道

cohpGenerator from 4.3 to 4.4   !指定待分析的原子对的距离

!cohpbetween atom 1 and atom 2    !或指定待分析的原子对的名称

 

Program2STUTTGART TB-LMTO https://www2.fkf.mpg.de/andersen/

STUTTGART TB-LMTO-ASA是一独立的计算软件。输入文件(CTRL)设置基本结构信息(类似于VASPPOSCAR)即可,其它参数可通过命令进行补全。建立输入文件后,进行自洽计算,然后对要分析的原子/离子对之间的成键特性(COOPCOHPICOHP等)进行分析。该软件通过指定原子球的名字来定义要分析的原子/离子对。该软件的优点之一是可以对电子化合物中间隙局域电子(ISQ)和原子/ISQ之间的成键特性进行分析。具体要求和计算流程详见手册。

CTRL例子:

STRUC ALAT=11.2683 lattice constant (单位是bohr

PLAT=1 0 0

0 1 0

0 0 1    lattice translation vectors

CLASS ATOM=NI Z=28 !原子名字和原子序数

ATOM=Se Z=34

SITE ATOM=NI POS= .0 .0 .0    !原子名字和原子坐标

ATOM=NI POS= .5 .0 .5

ATOM=NI POS= .0 .5 .5

ATOM=NI POS= .5 .5 .0

ATOM=Se POS= .383 .383 .383

ATOM=Se POS= .617 .617 .617

ATOM=Se POS= .117 .617 .883

ATOM=Se POS= .883 .383 .117

ATOM=Se POS= .617 .883 .117

ATOM=Se POS= .383 .117 .883

ATOM=Se POS= .883 .117 .617

ATOM=Se POS= .117 .883 .383

P.S. 两款软件都需要向开发者发送邮件进行申请。




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