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SciBet: 一种便捷式单细胞类型快速鉴定器

已有 3966 次阅读 2020-4-16 09:41 |个人分类:单细胞文献分类|系统分类:科研笔记

每天关注单细胞领域最新进展,速递1篇最新的高分文章


序号:2020-069


今天给大家安利一个最新的单细胞细胞类型鉴定软件,北大张泽明老师开发的,关键是很贴心的提供了一个在线工具,让不会生信编程的人也能方便使用(http://scibet.cancer-pku.cn/download_references.html)。




SciBet: 一种便捷式单细胞类型快速鉴定器

【文献类别】技术方法-细胞类型鉴定

【发表期刊】Nature Communications

【影响因子】 11.9

【发表时间】2020.04.14

【DOI】10.1038/s41467-020-15523-2

【文章摘要】单细胞RNA测序数据的监督细胞类型标注需要快速、稳健、独立技术的计算方法。作者提出了SciBet,一种监督式细胞类型标识符,可以准确地预测具有数量级速度优势的新测序细胞的细胞类型。作者提供了SciBet的web客户端部署,以实现快速的本地计算,而无需将本地数据上传到服务器。面对单细胞RNA数据集的指数增长,这个用户友好的跨平台工具可以广泛用于单细胞类型识别。




之前速递的2020年第1季度单细胞高分文献56篇的历史记录,

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