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R包:rdacca.hp(层次分割获取典范分析RDA, CCA和dbRDA单个解释变量的贡献)
赖江山 2020-12-4 22:25
典范分析( RDA,CCA 和 dbRDA )作为研究解释变量矩阵(通常是环境因子)解释响应变量矩阵(通常是物种数据)主要多元统计方法,广泛应用生态学与环境科学多元数据分析当中。在约束排序分析中,我们可以获得全模型(即包含所有环境因子)的解释率( RDA 称为 R 2 , CCA 称为解释率),即响应变量总变量( to ...
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reshape包的melt函数将宽数据变为长数据的函数
赖江山 2020-12-1 22:58
宽数据:宽数据是比较常用的数据收集与储存样式,群落学里面一般是表示为一列为一个变量,一行为一个样本,表格里面的值代表变量在样本里面的观测值。 长数据:长数据是一元统计分析可能会用到的样式,如将上面的每一列的值重叠形成新的一列,表示观测值。另外添加一列表示观测值所对应的变量名字。 Resh ...
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有一个计算生物多样性指数新R包adiv,发表在最新一期的MEE上
赖江山 2020-9-18 14:36
Sandrine Pavoine 在2020年6月Methods in Ecology and Evolution发表一个新包adiv: Anrpackage to analyse biodiversity in ecology。此包含有最全的生物多样性指数的计算函数。包括三个层次(α,β和γ)物种多样性、分类学多样性、功能多样性和谱系多样性。具体详见下面链接,值得关注! htt ...
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基于R语言的生态与环境科学数据分析培训班通知
赖江山 2020-9-1 14:59
华美同创文化交流(北京)有限公司 基于 R 语言的生态与环境科学数据分析培训班通知 ( 20 20 年9月11日 - 14 日,北京) 随着新的数据分析方法在生态学和环境科学研究中的迅速发展和大数据时代的来临,传统的统计软件已经很难满足当前的数据分析需求。 R ...
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R4.0的版本下定义泛函数的注意事项
赖江山 2020-7-29 14:51
最近在写一个典范分析(RDA,db-RDA和CCA)各个解释变量的重要性评估的R包。发现之前定义的作图泛函数plot.varcano在新版R.4.0后居然无法调用,一直无法找到原因,网上也搜不到有价值的材料,后来参考其他包的文件,偶然发现NAMESPACE文件里面有个类似声明: ## Registration of S3 methods defined in *** S3method(adip ...
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获取某一点的海拔高程的R函数
赖江山 2020-7-28 15:12
刚审稿发现有个可以获取一个北美经纬度点的海拔R包“elevatr” install.packages(elevatr) library(elevatr) mt_wash-data.frame(x=-71.3036,y=44.2700) mt_mans-data.frame(x=-72.8145,y=44.5438) mts ...
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《数量生态学-R语言的应用》中文版第二版已经出版
热度 2 赖江山 2020-5-17 20:32
《数量生态学-R语言的应用》中文版第二版已经由高等教育出版社出版! 本书全体数据和代码在此下载! 数量生态学-R语言应用(第二版)全部代码和数据.zip
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自动生成加入R方和P值散点二阶线性回归线图的函数
赖江山 2020-2-10 22:56
plotAnnotatedScatter-function(x,y,pointCol=rgb(0,0,0,0.7), legendPos=topleft, legendCex=1,Xlab=,Ylab=, ... ) { # Generate a linear model summary ...
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GMT+8, 2020-12-6 06:47

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