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利用GBLUP方法预测水稻杂交种得表现(文献解析)
邓飞 2016-7-31 17:33
利用 GBLUP 方法预测水稻杂交种得表现 Predicting hybrid performance in rice using genomicbest line unbiased prediction 发表杂志: PANS 发表单位:加州大学、华中农业大学 发表时间: 2014 年 5 月 摘要: 全基因组选择( Genomic selection , GS )是分子辅助选择( ...
个人分类: 文献解析|7850 次阅读|没有评论
无人机大批量采集玉米表型数据(文献解析)
邓飞 2016-7-31 17:19
对于田间试验和农业数据分析,请加入下面QQ群:VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群,可以点击这个链接,里面有大量的资料可以下载和交流:点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】: https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 利用空中摄像传感等方法批量获得玉米表型数据 Remote, ae ...
个人分类: 文献解析|5583 次阅读|没有评论
表型相关与遗传相关及其显著性检验(数据及代码分享)
邓飞 2016-7-31 17:13
2018-10-09 修改备注: 1, 将代码修改, AAfun包不太好装, 使用VSNR包 2, VSNR包中有model.comp和asreml.lrt两个函数, 可以进行模型的比较和LRT检验 3, 代码correlation.R correlation.R 附件重新上传. 4, 贴上了我的最新的微信公众号 表型相关与遗传相关及其显著性检验 ...
个人分类: 农学统计|11722 次阅读|没有评论
R语言汇总统计,包括分组数据的汇总,结果友好(代码分享)
邓飞 2016-7-5 09:00
这个包不是必须,如果没有这个包,感兴趣的人可以下载数据来演示: oats.csv library(asreml) library(reshape) library(pastecs) data(oats) head(oats) 第一种,通用的描述性统计一般是没有分组的变量,比如产量,胸径等 stat.desc(oats$yield,norm=T) 第二种,手动定义函数,然后可以分组 ...
个人分类: 农学统计|11981 次阅读|没有评论
ASReml-R多性状分析,怎么设置初始值?
邓飞 2016-6-23 18:22
建立了一个数据分析500人群,感兴趣的老师、同学 添加微信号: joinVSNC 为好友,拉你进入数据分析群 先进行单变量分析的原因: 1、确定显著性的因素(固定因素、随机因素),剔除不显著的 2、确定方差组分,为多变量分析时提供拟合初始值。 设置初始值的目的: 1、容易拟合 2、快速拟合 具体代码如下 ...
个人分类: 农学统计|2863 次阅读|没有评论
SAS 处理裂区试验代码
邓飞 2016-6-19 22:25
建立了一个数据分析500人群,感兴趣的老师、同学 添加微信号: joinVSNC 为好友,拉你进入数据分析群 这里的数据是GenStat里面的Oats.ghs data split; input block$ w$ s$ v$ n$ y; cards; 1 1 1 Marvellous 0.6cwt 156 1 1 2 Marvellous 0.4cwt 118 1 1 3 Marvellous 0.2cwt 140 1 1 4 Marvellous 0cwt ...
个人分类: 农学统计|2268 次阅读|没有评论
不同试验设计广义遗传率的分析
邓飞 2016-6-19 22:06
附件是不同试验设计广义遗传率分析的具体方法,包括随机区组、一年多点、多年多点怎么估算遗传率。 有问题的可以给我留言,或者发送邮件到Dave@vsni.co.uk。 农业试验中遗传率的计算方法.pdf
个人分类: 农学统计|2852 次阅读|没有评论
excel 计算哈温平衡的卡方和相应的p值
邓飞 2016-4-12 18:01
对于田间试验和农业数据分析,请加入下面QQ群:VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群,可以点击这个链接,里面有大量的资料可以下载和交流:点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】: https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 用excel函数计算 1、先算出p值 2、根据p值和自由度,计算卡方值 ...
个人分类: 农学统计|7147 次阅读|没有评论
农业上对不同品种照相,按照品种名称批量改变相片名称的方法
邓飞 2016-3-17 12:17
照片应该是一个品种一张,按品种排列的顺序,可以用perl,代码如下: #!/usr/bin/perl -w my $index=1; foreach $a(glob *jpg){ #注意点号不匹配东西,用问号匹配单个,星号匹配多个,默认当前目录 rename $a,$index.jpg; #可以用括号包含字符,点号也不匹配 $index++; } 不放心的话还可以弄成 ...
个人分类: 便捷操作|2270 次阅读|1 个评论
TASSEL 关联分析软件 起步教程
邓飞 2016-3-16 11:15
TASSEL 关联分析软件 起步教程 目录 1 、 下载安装软件 ... 1 2 、 导入数据 ... 1 3 、 处理数据 ... 3 3.1 清洗数据 ... 3 3.2 主成分分析 ... 5 3.3 用基因标记估计系谱 ... 5 3.4 ...
个人分类: 翻译博客|29774 次阅读|没有评论

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