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相关性网络计算新方法--MRHCA
刘华英 2018-6-29 16:48
相关性网络被广泛应用于各个科研领域。随着大数据时代的来临,各学科所面对的数据中的变量正在大幅度增加。相关性网络以及相关性网络中的模块识别,是一种简单有效表达变量间关系的方法,被广泛用于数据挖掘与可视化。但是,传统相关性网络的一个缺点是内存占用过大(内存需求正比于 N^2 , N 为变量数目),以及 ...
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Quantitative Biology (QB)期刊2018年第1期文章
刘华英 2018-3-21 11:07
Quantitative Biology (QB) 期刊 2018 年第 1 期文章发布在 ( https://link.springer.com/journal/40484/6/1/page/1 ) 和 ( http://journal.hep.com.cn/qb/EN/2095-4689/current.shtml )两个网站,此期文章可免费下载。文章主题涉及 biological oscillators; metabolic pathway; algorithm for large scale ne ...
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“系统生物学在中医药研究中的应用” 专辑征稿
热度 1 刘华英 2018-2-1 14:55
Quantitative Biology ( QB ) 期刊正发起专辑 “ 系统生物学在中医药研究中的应用 ” 专辑编辑: 我们很荣幸邀请到了北京大学定量生物学中心的来鲁华教授和清华大学信息科技国家实验室 ( 筹 ) 生物信息学部的李梢教授来担任此期专辑编辑,在这两位专家的精心策划下,将为广大科 ...
个人分类: 学术期刊|2073 次阅读|4 个评论 热度 1
Quantitative Biology推出精准医学专刊
刘华英 2018-2-1 14:31
近年来,精准医学受到广泛关注,为了集中体现精准医学发展的脉络和前沿的进展,QB 特推出精准医学专刊,从多个层面进行了展示。 专刊特别编辑是来自 美国埃默里大学 (Emory University)的Zhaohui S.Qin博士。 精准医学领域还有很多未解之谜、技术难关需要跨越和解决。在临床中最终应用精准医学,尤其是需要一系列包括信 ...
个人分类: 学术期刊|1778 次阅读|没有评论
中科院—马普学会计算生物伙伴研究所的专家和青年优秀计算生...
刘华英 2018-2-1 14:19
Quantitative Biology期刊2017年第5卷第3期(https://link.springer.com/journal/40484/5/3/page/1) 发表 来自中科院 — 马普学会计算生物伙伴研究所的专家和青年优秀计算生物学学者的专题,为国家生物医学大数据中心的成立贡献一份力量。本期专题涉及领域有:环形 RNA 形成机制 (circRNA formation); 单细胞 RNA 测 ...
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Quantitative Biology 2017年第2期发表生物3D打印主题文章
刘华英 2017-6-23 13:33
Quantitative Biology 第5卷第2期发表生物3D打印主题文章,通讯作者来自中国科学院遗传与发育生物学研究所的王秀杰研究员,她在文中评述了组织工程中3D打印策略以及未来的研究前景。详细的内容发表在QB2017年第2期: Review Engineering synthetic optogenetic networks for biomedical applications Meiyan Wan ...
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Quantitative Biology期刊2017年第一期合成生物学专辑
刘华英 2017-6-23 13:16
Quantitative Biology期刊2017年第5卷第1期发表合成生物学专辑,出版10篇文章(详见 https://link.springer.com/journal/40484/5/1/page/1 或 http://journal.hep.com.cn/qb/EN/2095-4689/current.shtml ),全文免费下载,本期特约编辑是来美国加州达维斯学校的Cheemeng Tan 博士和中国科学技术大学的刘海燕教授。 ...
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三维基因组研究方法
刘华英 2016-8-18 09:34
对于人的每个细胞来说,其两米长的 DNA 不但可以很轻松地压缩到大约 5 微米的细胞核中,还要保证转录、翻译、基因修复等细胞过程的正常进行,这本身就提示基因组的三维结构信息对于生命活动是极端重要的。目前约有三种方法来研究三维基因组:以分子生物学为基础的 molecular mapping 、分子影像学、及定量计算方法 ...
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Quantitative Biology 2015年第3卷第4期文章信息
刘华英 2016-1-18 16:35
Review On statistical energy functions for biomolecular modeling and design Haiyan Liu Pages 157-167 Download PDF (687KB) Review Quantitative analysis of gene expression systems Tianshou Zhou , Tuoqi Liu Pages 168-181 Download PDF (607KB) Review Mathematical a ...
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