省之以明德分享 http://blog.sciencenet.cn/u/wangshu TopLiuChao@Gmail.com

博文

gaussian 简单计算小得

已有 4590 次阅读 2012-1-31 22:50 |个人分类:化学|系统分类:科研笔记| 化学, 计算, gaussian

下面的小知识点很简单,只是用得少,老是记不住,就写出来列于此,,好记性不如烂笔头嘛
==============
1)
0 1

这里的0是电荷,1是多重度,即2S+1=2*0+1=1
若一中性分子的电荷,多重度分别不为0,1,则可能是多输了H,或电子,可以用右键>view>label来找,或菜单>edit>atom list中找。


2) geom=connectivity
是指明确原子之前连接方式,如果在原子位置后标注连接方式则必须用这个命令;要删全删,要留全留。

3)opt指优化结构,如果算已有结构,如晶体的定点能,则不需此命令。

4)即使有晶体结构,也要优化结构,一是作类比较,二是验证此基组适用的可行性。
============
数据举例,来源,CHEM. COMMUN. , 2003, 2116–2118,CCDC:211977
%chk=CB.chk
%mem=2500MB
%nprocl=1
%nprocs=8
# b3lyp/3-21G geom=connectivity opt

CB

0 2
 O                 -1.76400000   11.13560000    4.01040000
 O                 -1.00400000   13.23060000    4.01130000
 C                  3.24620000   12.74610000    5.82070000
 C                  3.31200000   14.36970000    5.86070000
 C                  4.62480000   14.92760000    6.26510000
 C                  5.67340000   14.16090000    6.72830000
 C                  5.61390000   12.69150000    6.68790000
 C                  4.50420000   12.04830000    6.18680000
 C                  4.67770000   10.93430000    5.28310000
 C                  3.66800000   11.01310000    4.25400000
 C                  2.85330000   12.17760000    4.50200000
 C                  2.42990000   12.93000000    3.42910000
 C                  2.49170000   14.40400000    3.46690000
 C                  2.98100000   15.05470000    4.58220000
 C                  3.89880000   16.15440000    4.40660000
 C                  4.90220000   16.07580000    5.43260000
 C                  6.20620000   16.47750000    5.16550000
 C                  7.30280000   15.68150000    5.67130000
 C                  7.03490000   14.54540000    6.41880000
 C                  7.81270000   13.34730000    6.19520000
 C                  6.93810000   12.20560000    6.34520000
 C                  7.10580000   11.09580000    5.54110000
 C                  5.94430000   10.44010000    4.98210000
 C                  6.24180000   10.01680000    3.63740000
 C                  5.28070000   10.08840000    2.64130000
 C                  3.95890000   10.59560000    2.95880000
 C                  3.48160000   11.36600000    1.84110000
 C                  2.74470000   12.52000000    2.07740000
 C                  3.00320000   13.71060000    1.28860000
 C                  2.84950000   14.85820000    2.15190000
 C                  3.68870000   15.96390000    1.98290000
 C                  4.22500000   16.63050000    3.13960000
 C                  5.58480000   17.03350000    2.84470000
 C                  6.55840000   16.95630000    3.84120000
 C                  7.87640000   16.45110000    3.51990000
 C                  8.33390000   15.66330000    4.65310000
 C                  9.08140000   14.52020000    4.44260000
 C                  8.82170000   13.32760000    5.23010000
 C                  8.97820000   12.17640000    4.37280000
 C                  8.13700000   11.07830000    4.51980000
 C                  7.60210000   10.41370000    3.34810000
 C                  7.93950000   10.86570000    2.07200000
 C                  6.93140000   10.93790000    1.04000000
 C                  5.62270000   10.55680000    1.31180000
 C                  4.51630000   11.35180000    0.82050000
 C                  4.75940000   12.49080000    0.07470000
 C                  3.98680000   13.69090000    0.30710000
 C                  4.86470000   14.83290000    0.14460000
 C                  4.72190000   15.94390000    0.95880000
 C                  5.89140000   16.61070000    1.50020000
 C                  7.16190000   16.12730000    1.18790000
 C                  8.17790000   16.04970000    2.22530000
 C                  8.94950000   14.84860000    2.00490000
 C                  9.39400000   14.10150000    3.09610000
 C                  9.32420000   12.64820000    3.04980000
 C                  8.81900000   12.00850000    1.92780000
 C                  8.35480000   12.79150000    0.79700000
 C                  8.41560000   14.17500000    0.83360000
 C                  7.31430000   14.96860000    0.33470000
 C                  6.18380000   14.34060000   -0.17310000
 C                  6.12490000   12.89200000   -0.22510000
 C                  7.18130000   12.13560000    0.24900000
 C                  2.36230000   13.56340000    6.73990000
 C                  2.67400000   13.59320000    8.21560000
 C                  2.75730000   12.43390000    8.97120000
 C                  2.98080000   12.51050000   10.33750000
 C                  3.14370000   13.72670000   10.95180000
 C                  3.06950000   14.89230000   10.20790000
 C                  2.82790000   14.82210000    8.84660000
 C                  0.87330000   13.58330000    6.39020000
 C                  0.19050000   12.22970000    6.60460000
 C                 -1.27100000   12.21200000    6.10350000
 C                 -1.38760000   12.10640000    4.61500000
 C                 -0.96090000   13.17800000    2.55440000
 H                  2.61900000   11.58570000    8.53800000
 H                  3.04770000   11.72860000   10.85410000
 H                  3.33290000   13.82080000   11.88330000
 H                  3.20620000   15.76940000   10.62210000
 H                  2.84250000   15.67120000    8.31090000
 H                  0.42290000   14.29440000    7.00660000
 H                  0.74840000   13.89850000    5.43050000
 H                  0.24080000   12.02210000    7.60170000
 H                  0.72430000   11.45640000    6.12160000
 H                 -1.75880000   13.06610000    6.37680000
 H                 -1.67030000   11.38940000    6.45750000
 H                 -1.87310000   13.08920000    2.23900000
 H                 -0.58960000   14.07390000    2.25580000
 H                 -0.34920000   12.41000000    2.23220000
 ?s                 2.97920000    8.99550000    8.13160000
 ?s                 2.52550000    7.15780000    0.26900000
 ?s                 2.52550000    7.15780000    0.26900000
 ?s                 0.07150000    8.21900000   -0.47260000
 ?s                 0.07150000    8.21900000   -0.47260000

 1 73 2.0
 2 73 1.0 74 1.0
 3 4 1.0 8 1.0 11 1.0 63 1.0
 4 5 1.0 14 1.0 63 1.0
 5 6 1.0 16 1.0
 6 7 1.0 19 1.0
 7 8 1.0 21 1.0
 8 9 1.0
 9 10 1.0 23 1.0
 10 11 1.0 26 1.0
 11 12 1.0
 12 13 1.0 28 1.0
 13 14 1.0 30 1.0
 14 15 1.0
 15 16 1.0 32 1.0
 16 17 1.0
 17 18 1.0 34 1.0
 18 19 1.0 36 1.0
 19 20 1.0
 20 21 1.0 38 1.0
 21 22 1.0
 22 23 1.0 40 1.0
 23 24 1.0
 24 25 1.0 41 1.0
 25 26 1.0 44 1.0
 26 27 1.0
 27 28 1.0 45 1.0
 28 29 1.0
 29 30 1.0 47 1.0
 30 31 1.0
 31 32 1.0 49 1.0
 32 33 1.0
 33 34 1.0 50 1.0
 34 35 1.0
 35 36 1.0 52 1.0
 36 37 1.0
 37 38 1.0 54 1.0
 38 39 1.0
 39 40 1.0 55 1.0
 40 41 1.0
 41 42 1.0
 42 43 1.0 56 1.0
 43 44 1.0 62 1.0
 44 45 1.0
 45 46 1.0
 46 47 1.0 61 1.0
 47 48 1.0
 48 49 1.0 60 1.0
 49 50 1.0
 50 51 1.0
 51 52 1.0 59 1.0
 52 53 1.0
 53 54 1.0 58 1.0
 54 55 1.0
 55 56 1.0
 56 57 1.0
 57 58 1.0 62 1.0
 58 59 1.0
 59 60 1.0
 60 61 1.0
 61 62 1.0
 62
 63 64 1.0 70 1.0
 64 65 1.0 69 1.0
 65 66 1.0 75 1.0
 66 67 1.0 76 1.0
 67 68 1.0 77 1.0
 68 69 1.0 78 1.0
 69 79 1.0
 70 71 1.0 80 1.0 81 1.0
 71 72 1.0 82 1.0 83 1.0
 72 73 1.0 84 1.0 85 1.0
 73
 74 86 1.0 87 1.0 88 1.0
 75
 76
 77
 78
 79
 80
 81
 82
 83
 84
 85
 86
 87
 88
 89
 90
 91
 92
 93



https://wap.sciencenet.cn/blog-216119-533157.html

上一篇:天赋、训练、机缘和功夫
下一篇:用砂芯漏斗过滤除去溶液中的硅胶
收藏 IP: 219.234.148.*| 热度|

0

发表评论 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-3-28 22:16

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部