科学网—xiongchaoliang的留言板

IP: 112.93.112.* [5]hjdwenzi 2016-6-11 00:16

Linux x86_64 binary请问这个可以在哪里下载呢？

IP: 175.0.174.* [4]严莉 2016-2-23 17:45

师兄，您好，想向您请教一下怎么用miRcode预测miRNA上有哪些lncRNA的结合位点？第一次用，希望师兄能能帮帮忙，太感谢了！

我的回复(2016-2-25 22:50)：我之前做过lncRNA上面miRNA结合位点的预测，采用的工具是miRDB (http://www.mirdb.org/miRDB/).

IP: 183.247.166.* [3]gaoxiaoqing123 2015-11-4 16:18

您好！我想问一下，miRcode是否只能做人类的lncRNA分析？其它物种可以做吗？
这个能下载下来用吗？
谢谢，祝好！

我的回复(2015-11-7 18:36)：是的，只能做人的。<“MiRcode provides "whole transcriptome" human microRNA target predictions based on the comprehensive GENCODE gene annotation, including >10,000 long non-coding RNA genes.”>.
可以下载下来用。

IP: 159.226.43.* [2]熊朝亮 2014-12-30 11:22

原因可能有两个:
1.你的diff_out这个文件夹是空的；
2. readCufflinks("diff_out")中diff_out的输入路径可能不对。

IP: 66.62.136.* [1]李钊 2014-12-30 10:00

您好，我安装完cummeRbund后，library（cummeRbund）也正常，但是cuff_data <- readCufflinks("diff_out")
这步就是读不了数据，生成的cuffdata.db是空的，您知道是什么原因吗，谢谢了

不积小流 , 无以成江海 ！分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xiongchaoliang

留言板

熊朝亮

不积小流 , 无以成江海！分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xiongchaoliang