不积小流 , 无以成江海 !分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xiongchaoliang

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DisNor---疾病-基因调控网络数据库
2019-12-17 12:17
DisNor https://disnor.uniroma2.it/ A disease-focused resource that uses the causal interaction information annotated in SIGNOR and the protein interaction data in mentha to generate and explore protein interaction networks linking disease genes. 支持按照疾病名、基因名、SNP号、多蛋白搜索。
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转座子(Transposon)专题
热度 1 2019-11-9 00:21
转座子(Transposon)定义 (From: Wikipedia): A transposable element (TE, transposon, or jumping gene) is a DNA sequence that can change its position within a genome, sometimes creating or reversing mutations and altering the cell's genetic identity and genome size. Transposition often res ...
个人分类: 【转录组-mRNA分析】|50184 次阅读|1 个评论 热度 1
微信公众号文章搜索助手v20190924
2019-10-21 15:16
微信公众号文章搜索助手的功能介绍以前分享过(见链接: http://blog.sciencenet.cn/blog-1509670-1177066.html) 主界面 由于不能对之前的博客进行评论和修改,现将其更新版本和源下载链接分享如下: https://www.juyimv.cn/soft/
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自噬研究相关数据库
2019-10-21 09:46
HADb: Human Autophagy Database http://www.autophagy.lu/index.html AUTOPHAGY DATABASE http://www.tanpaku.org/autophagy/index.html HAMdb http://hamdb.scbdd.com/
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密码子优化网站集锦
2019-8-30 00:59
1. http://www.detaibio.com/tools/ 虽然名气不大,但功能很强大 。 2. http://www.kazusa.or.jp/codon/ 这是日本一个专门的密码子数据库,在里面先输入你要表达的动物的名称,就可以得到关于这个哺乳动物表达系统的密码子偏爱性表,然后把氨基酸序列翻译成相应的偏爱密码子就可以了! 3. https://www.vectorbu ...
个人分类: 【数据库】|5635 次阅读|1 个评论
TRRUST---转录因子-靶基因数据库
2019-8-28 20:02
网址: https://www.grnpedia.org/trrust/ 这个数据库最早是韩国人在2014年构建的,目前,这个数据库已经是第2个版本了。该数据库使用MeSH词汇查询、不断改进的sentence-based文本挖掘算法,加之挖掘后仔细的人工校对,保证了该数据库中的TF-target调控互作都是经过实验验证的。目前该数据库收录了已经报道的人和小鼠 ...
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SymMap---TCM enhanced by symptom mapping
2019-8-28 11:13
网址: http://www.symmap.org/ Reference: Wu Y, Zhang F, Yang K, Fang S, Bu D, Li H, Sun L, Hu H, Gao K, Wang W, Zhou X. SymMap: an integrative database of traditional Chinese medicine enhanced by symptom mapping. Nucleic acids research. 2018 Oct 31;47(D1):D1110-7.
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I-TASSER-----蛋白结构预测
2019-8-23 15:08
I-TASSER是由密歇根大学张阳课题组开发的在线结构预测的工具,其2015年发布在线服务版本的文章已经被引300多次,而在同一年,其发布了I-TASSER独立版本的文章,目前已经被引超过2000次,I-TASSER页面如下图: 在使用I-TASSER之前,必须要用 学术邮箱 进行注册,注册完后会在邮箱收到密码。用户提交任务需要输入蛋白序 ...
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TumorPortal---Genes, Cancers, DNA Mutations & Annotations
2019-8-17 09:16
TumorPortal侧重于基因突变与肿瘤的关系及其注释。 WebSite: http://www.tumorportal.org/ Pan-cancer dataset could be explored (1) by Tumor Types; (2) by Genes; (3) by Figures. References: Lawrence, M.S., Stojanov, P., Mermel, C.H., Robinson, J.T., Garraway, L.A., Golub, T.R., Meyerson, M., ...
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