不积小流 , 无以成江海 !分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xiongchaoliang

博文

KnockTF---转录因子敲除/低的表达谱整合数据库

已有 1191 次阅读 2020-9-28 22:41 |个人分类:【数据库】|系统分类:科研笔记

KnockTF
http://www.licpathway.net/KnockTF/index.html
1.png
2.png
       KnockTF 包括308个转录因子相关的570个手动整理的RNA-seq和微阵列数据集,这些TF被敲除/低,并且跨越多种组织/细胞类型,表达谱数据来自AnimalTFDB ,TcoF-DB 和ENCODE,转录因子启动子及相关表观遗传信息来自UCSC、roadmap等数据库。
       此外,KnockTF构建了一个TF差异表达的基因网络,并对感兴趣的基因集进行网络分析,例如子网络位置,拓扑分析和超几何富集。



http://wap.sciencenet.cn/blog-1509670-1252493.html

上一篇:HuRI---人类蛋白质互作图谱计划
下一篇:肿瘤血液标志物数据库

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-4-22 02:42

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部