Illumina测序接头

熊朝亮 2018-5-6 16:01

Illumina测序接头 Illuminax测序接头.pdf

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单细胞测序的实验设计与分析

熊朝亮 2015-11-18 15:58

Design and Analysis of Single-Cell Sequencing Experiments. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867415013537

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已发表陆生植物基因组(up to 2015-08-15)

熊朝亮 2015-8-15 17:41

Chinese name Organism/Name Kingdom Group SubGroup Size (Mb) Chrs Organelles Plasmids Assemblies 猕猴桃 Actinidia chinensis Eukaryota Plants Land Plants 604.217 - 1 - 1 山羊草 Aegilops tauschii Eukaryota Plants ...

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已发表哺乳动物基因组(up to 2015-08-15)

熊朝亮 2015-8-15 16:07

Chinese name Organism/Name Group SubGroup Size (Mb) GC% Genes Proteins Release Date Level 人类 Homo sapiens Animals Mammals 3221.49 41.4459 56001 102475 2002/8/2 Chromosome 小鼠 Mus musculus Animals Mammals 2800.06 ...

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云生信---bioinformatics clou

熊朝亮 2014-12-3 22:39

随着计算机技术的发展，‘ 云 ’ 频繁的出现在我们的视野里， 云平台 、 云计算 、 云服务 、 云存储 。 “ 云 ” 的定义，大量用网络连接的计算资源统一管理和调度，构成一 个计算资源池，向用户按需提供服务，按需供给资源。 “ 云 ” 是大数据的产物，它的概念不仅限于计算机领域，已经延伸到生命科学领域 ...

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fasta与fastq格式文件解读

熊朝亮 2014-12-3 22:32

1 、 FASTA 文件的格式 在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式）是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示，且允许在序列前添加序列名及注释。 FASTA 文件以序列表示和序列作为一个基本单元，各行记录信息如下： 第一行是由大于号 ...

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Illumina/454/ABI三种测序平台原理的比较

熊朝亮 2014-11-30 00:01

三种测序平台原理的比较： Illumina--454--ABI三种测序平台原理的比较.pdf

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测序中的duplicate是什么？

熊朝亮 2014-11-29 23:51

我看到GATK的best practice中说道“ Duplicately sequenced molecules shouldn't be counted as additional evidence for or against a putative variant. By marking these reads as duplicates the algorithms in the GATK know to ignore them. ” 我在网上也查过好多次了，可是还是不太明白这个duplicate是 ...

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