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rvcheck: R/Package Version Check——Update R packages
郑俊娟 2017-7-7 12:20
更新R较为无痛的方法已经在 hello yosemite 一文中提及。今天Bioconductor发布3.4版本,又是更新R包的时候了。 之前为了 吐槽 很多人问问题都是在使用早已不维护的老版本,写了 rvcheck 来帮忙检查版本。既然能够帮我们检查版本,自然能够帮忙升级。 使用rvcheck::update_all()可以自动更新CRAN, Bioconductor和Githu ...
个人分类: R语言|3081 次阅读|没有评论
Convert Gene Symbols To EntrzID
郑俊娟 2017-6-26 17:12
library(org.Hs.eg.db) symbols - c('JAK1','AATK','A2BP1','A2LD1')select(org.Hs.eg.db, symbols, c(ENTREZID,GENENAME), ALIAS) ALIAS ENTREZID GENENAME1 1 JAK1 3716 Janus kinase 1 2 AATK 9625 apoptos ...
个人分类: R语言|2690 次阅读|没有评论

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