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置顶 · 学习生物信息的第二好教程
2017-7-7 08:15
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需要修改,结果可以出 ...
个人分类: 生物信息|6594 次阅读|没有评论
R 学习矩阵操作
陈同 2018-4-29 01:14
Jump to... R基础概念和困惑点 获取帮助文档,查看命令或函数的使用方法、事例或适用范围 R中的变量 R中矩阵运算 R中矩阵筛选合并 str的应用 R的包管理 R的交互式运行 R基本语法 生信宝典,一起换个角度学生信 R基础概念和困惑点 插播一点R的基础概念和 ...
个人分类: 生物信息|2135 次阅读|没有评论
R统计绘图 - 热图美化
陈同 2018-4-28 23:07
R统计绘图 - 热图美化 Jump to... 热图美化 对数转换 Z-score转换 抹去异常值 非线性颜色 调整行或列的顺序 生信宝典,一起换个角度学生信 热图美化 上一期的绘图命令中,最后一行的操作抹去了之前设定的横轴标记的旋转,最后出来的图比较难看。 上次我们是这 ...
个人分类: 生物信息|3028 次阅读|没有评论
R统计绘图 - 热图
陈同 2018-4-28 23:05
R统计绘图 - 热图 Jump to... 热图绘制 生成测试数据 转换数据格式 分解绘图 图形存储 生信宝典,一起换个角度学生信 热图绘制 热图是做分析时常用的展示方式,简单、直观、清晰。可以用来显示基因在不同样品中表达的高低、表观修饰水平的高低等。任何一个数值矩阵 ...
个人分类: 生物信息|4273 次阅读|没有评论
R统计绘图 - 热图简化
陈同 2018-4-28 22:53
R统计绘图 - 热图简化 Jump to... 热图绘制 - pheatmap 不改脚本的热图绘制 生信宝典,一起换个角度学生信 热图绘制 - pheatmap 绘制热图除了使用 ggplot2 ,还可以有其它的包或函数,比如 pheatmap::pheatmap (pheatmap包中的pheatmap函数)、 gplots::heatmap.2 等。 相比 ...
个人分类: 生物信息|4609 次阅读|没有评论
学习生信的系列书籍
陈同 2018-4-28 22:06
学习生信的系列书籍 每次遇到有人问怎么学生信时,总会碰到一个尴尬的问题,“有没有什么书可以推荐下”。骤然之下,也不知道该怎么回答。这个问题有点大,想不到一本书可以囊括。而且对提问人的基础和学习倾向没有了解,与其指条错路,还不如不指。最后我都都会说,看生信宝典吧,有一系列由浅入深的 Linux教程 ...
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一个月学会Python的Quora指南和资料放送
陈同 2018-4-28 19:52
一个月学会Python的Quora指南和资料放送 Jump to... 第1周 第2、3、3.5 周 第3.5/4 周 Awk Sed Bash Vim C Markdown Octave Python R Regular Expressions Cloud Computing Datamining Machine Learning Competitive Pr ...
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高颜值可定制在线作图工具-第二版
陈同 2018-4-28 19:18
高颜值可定制在线作图工具-第二版 Jump to... 访问统计 功能改进 R绘图文章 激动人心的访问地址 生信宝典推出之前推出了一系列画图相关文章,包括多种形式的热图、线图、柱状图、箱线图、泡泡图、韦恩图、进化树、火山图、生存分析、共表达分析聚类如等( 可点击文末链接直达 ...
个人分类: 生物信息|4071 次阅读|没有评论
你该知道的杂志分区和影响因子及最新表格下载
陈同 2018-4-28 19:16
你该知道的杂志分区和影响因子及最新表格下载 Jump to... 影响因子 SCI影响因子的影响因素 闲话journal 何为期刊分区 汤森路透分区 中科院分区 两种分区方法的比较 期刊搜索 Clarivate Analytics bioRxiv 论文造假 h-index科普 ISI每年出 ...
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你和PPT高手之间,就只差一个iSlide
陈同 2018-4-28 18:08
你和PPT高手之间,就只差一个iSlide Jump to... 样式统一 导出长图或视频 快速布局 海量图标、图片、主题 PPT瘦身 做幻灯展示是我们日常工作中不可缺少的一部分,有的人喜欢用代码如 Latex , markdown+pandoc+revealjs 或 bookdown 。这些都是自动化做幻灯 ...
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