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简化lefse图流程
王敬敬 2021-8-31 09:36
参考http://blog.sciencenet.cn/blog-3334560-1161388.html ( 1 )删除非 marker 物种,保留 marker 物种,格式如下 &n ...
个人分类: 生物信息学|373 次阅读|没有评论
2020 Plant Soil: 微生物接种剂来源对植物和根际微生物组的影响
王敬敬 2021-3-6 09:46
The effect of microbial inoculant origin on the rhizosphere bacterial community composition and plant growth-promotion 微生物菌剂来源对根际细菌群落组成及促进植物生长的影响 摘要 目的: 微生物接种被认为是一种潜在的根际工程方法。然而,目前尚不清楚微生物菌剂的来源在多 ...
个人分类: 生物肥料|1420 次阅读|没有评论
2013--微生物组学:万物的细菌理论
王敬敬 2020-12-28 17:37
Microbiomics: The Germ Theory of Everything 微生物组学:万物的细菌理论 快速、廉价的 DNA 测序技术现在允许科学家研究不可培养的微生物;结果挑战了生物学的一些最基本概念。 -- 艾伦 · 多夫 在 19 世纪,一些生物学家开始支持一个明显荒谬的理论:疾病不是由每个人都 ...
个人分类: 生物信息学|957 次阅读|没有评论
2013--PVC超级门:细菌定义的例外?
王敬敬 2020-8-13 11:14
PVC 超级门:细菌定义的例外? PVC 超级门是在 16S rRNA 基因序列分析的基础上初步提出的一个细菌领域独特门的类群。它由浮霉菌门 Planctomycetes ,疣微菌门 Verrucomicrobia 和衣原体门 Chlamydiae 组成,但其他几个门也被认为是成员,包括黏胶球形菌门 Lentisphaerae 和其他几个仅由尚未培养的成员组成的 ...
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[转载][linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行
王敬敬 2020-7-30 17:36
👢 根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行 郑宝童 关注 1 2018.11.03 14:19:05 字数 331 阅读 2,044 一、待解决问题 科室里的一个小伙伴打算根据A文件中的ID列,提取B文件中所有包含相应ID的行。 A文件如下所示。 tip: ID列指的是图中带红框的那列,A大小7 ...
个人分类: 生物信息学|2388 次阅读|没有评论
[转载]解决 Endnote 的 Word 插件 不自动加载
王敬敬 2020-7-22 17:33
转载: 解决 Endnote 的 Word 插件 不自动加载 https://jingyan.baidu.com/article/6c67b1d63bda0f6786bb1e4e.html 问题描述和注意事项 1 明明安装了Endnote,但在Word启动时,不自动加载Endnote插件。结果,Word软件最上方,根本就没有Endnote的选项卡。下面介绍怎样使Endnote ...
个人分类: 软件技术等|2347 次阅读|没有评论
2012ISME:利用网络分析探讨土壤微生物群落共现模式
王敬敬 2020-7-22 13:42
Using network analysis to explore co-occurrence patterns in soil microbial communities 利用网络分析探讨土壤微生物群落共现模式 摘要 探索由高通量 DNA 测序技术产生的大型环境数据集需要新的分析方法,以超越对自然微生物群落组成和多样性的基本清单描述。为了研究微生物类群之间潜 ...
个人分类: 网络分析|4250 次阅读|没有评论
带有显著性标记的相关性热图绘制方法
王敬敬 2020-7-21 10:52
带有显著性标记的相关性热图绘制方法 参考文献: https://www.jianshu.com/p/d86ddf8fd48f https://mp.weixin.qq.com/s/5tHE5apk2SwDmcSLYQx48Q #psych 包用于计算相关性、 p 值等信息 library(psych) #pheatmap 包用于绘制相关性热图 libra ...
个人分类: 生物信息学|4027 次阅读|没有评论
[转载]解决 Rtools is required to build R packages but is not current
王敬敬 2020-7-20 16:13
R 4.0 版本安装 rtools40教程,解决 Rtools is required to build R packages but is not currently installed 问题 Elendill 2020-04-30 16:55:41 10966 收藏 39 版权 正确安装Rtools 4.0 版本 出现的问题 解决方案 一、下载rtools 二、安装 三、配置rtools路径 1. 创建路径配置文件 ...
个人分类: 生物信息学|7723 次阅读|没有评论
微生物接种剂全球市场from marketsandmarkets
王敬敬 2020-7-14 15:37
不同类型(农业接种剂和青贮菌剂),微生物(细菌和真菌),作物类型(油籽和豆类、谷物和谷物、水果和蔬菜,和饲料)和地区的接种剂市场 -- 到 2025 年的全球预测 https://www.marketsandmarkets.com/Market-Reports/agricultural-inoculants-market-152735696.html Markets an ...
个人分类: 生物肥料|1132 次阅读|没有评论

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