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批量下载pdb

已有 4230 次阅读 2013-12-28 12:00 |个人分类:DrugDesign|系统分类:科研笔记

不要使用linux的wget命令,

不要使用迅雷的新建url任务来下载,pdb.org 防止下载机器人

建议使用pymol的fetch来下载

http://www.pymolwiki.org/index.php/Fetch

fetch下载下来的文件都是小写的字母命名的,

如果要改成大写的,利用linux的tr和mv命令以及rename 命令

for i in $(ls);do newname=$(echo $i|tr 'a-z' 'A-Z');mv $i $newname;done

############

rename .PDB .pdb ./*

###############



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