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熊荣川
xiong rongchuan
六盘水师范学院生物信息学实验室
xiongrongchuan@126.com
http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz
Raxml在处理大数据,构建基于ML方法的发育树方面具有快速准确的有点。然而繁琐的命令总让人头痛。Silvestro, D. and I. Michalak (2012).[ "raxmlGUI: a graphical front-end for RAxML." Organisms Diversity & Evolution 12(4): 335-337.] 开发的可视化软件成功的解决了这一难题。
在官网上下载程序包,解压后可以双击“raxmlGUI.py”直接使用。
有两点值得注意:
1、你的系统必须安装有Python,
而且不支持phthon 3.0以上的版本,我下载使用2.6.6版本亲测可用。
http://www.python.org/download/releases/2.6.6/
2、比对好的序列文件须是phy格式,且放在非中文路径上。
3、可用clustalX把fasta格式文件转换为phy格式文件。
4、加载的序列存在路劲上不能有中文。
5、phython和raxmlgui必须安装在同一路径下。
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GMT+8, 2024-9-24 20:13
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