张叔勇
鱼类中套式病毒并不罕见
2020-6-20 10:52
阅读:4816
标签:套式病毒, 新冠病毒, 冠状病毒

    据中国疾控中心病毒病所提供的消息,6月14日和15日、17日,中国疾控中心病毒病所工作人员先后3次进入新发地农产品批发市场,并曾经在一整条三文鱼的口腔拭子中检测到新冠病毒。从病毒的基因组分析来看,病毒更接近新冠病毒欧洲流行株,但是它比现在欧洲流行的病毒株要更古老。

    三文鱼嘴里的病毒是哪里来的暂且放下不说,那么分割三文鱼的砧板上的病毒就很可能来自于三文鱼本身了。但是,三文鱼细胞上并不含有与哺乳动物高度同源的ACE2受体,是不会感染新冠病毒的,所以,还是将目标投向环境污染,如养殖海水污染、冷冻用冰块污染等等。

    但是也有朋友说,前几天看到一篇文献解读,说三文鱼会感染一种太平洋鲑套式病毒Pacific salmon nidovirus (PsNV),这种病毒与冠状病毒有相似之处,所以认为“三文鱼或可感染新冠病毒”。因为碰巧在河蟹中发现过类似的套式病毒,所以也算是对套式病毒有所了解,根据NCBI基因组分类,PsNV并未划分在冠状病毒科,与冠状病毒科的同源性大约在30%以下,与新冠病毒所在的属亲缘关系更远一些。这种相似性与新冠病毒及SARS的不同毒株彼此间同源性在90%左右甚至更高完全不一样。
    2018年ICTV调整了套式病毒目的分类,在冠状病毒科(Coronaviridae)、动脉炎病毒科(Arteriviridae)、杆套病毒科(Roniviridae)基础上新增了Abyssoviridae、Medioniviridae、Mononiviridae、Euroniviridae和Tobaniviridae等5个病毒科,此外尚有多个新的特殊分类待定。

    实际上,鱼类中还是广泛存在这类套式病毒的,而且分属于不同的科属,表现出丰富的多样性。如太平洋鲑套式病毒Pacific salmon nidovirus 、大鳞大麻哈鱼套式病毒Chinook salmon nidovirus(Tobaniviridae病毒科)、肥头鲤套式病毒Fathead minnow nidovirus、白鳊套式病毒White bream nidovirus(Bafinivirus鳊鱼病毒属,Tobaniviridae,原Torovirinae环曲病毒亚科),黄颡鱼冠状病毒yellow catfish bafinivirus、鲫鱼冠状病毒Crucian Carp Bafinivirus等等。这些病毒,不仅基因组相似性与新冠病毒差别很大,而且形态也不一样,其中不少为短杆状而非球型。套式病毒在昆虫、甲壳动物、爬行动物中也有广泛的分布。

 

 

    目前国内已有几个单位开展有相关研究,我也有初步发现,在此就不再多叙。借用一下文献中的进化树看看鱼类套式病毒之间的亲缘关系:


 




 

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