张世成
蛋白质学科常用工具总结 V1.0
2013-10-21 17:29
阅读:5161
标签:蛋白质, 常用工具

Motif predition

ScanProsite

(http://prosite.expasy.org/scanprosite/)

 

Secondary structure prediction and modeling

Phyre2

(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)

 

PSIPRED

(http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/)

 

Domain analysis

SMART

(http://smart.embl-heidelberg.de/)

 

ELM

(http://elm.eu.org/search/)

 

Pfam

(http://pfam.sanger.ac.uk/)

 

Domain Architecture Retrieval Tool

(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/lexington/lexington.cgi)

 

Subcellular localization

PSORT

(http://psort.hgc.jp/)

 

Protein struture alignment

Dali Sever

(http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali_server/)

 

Genome Database

Candida

(http://www.candidagenome.org/)

 

Saccharomyces

(http://www.yeastgenome.org/)

 

 

Other

ESPripts 2.2

(http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/)


2013.10.21

转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来自张世成科学网博客。

链接地址:https://wap.sciencenet.cn/blog-46763-734780.html?mobile=1

收藏

分享到:

当前推荐数:0
推荐到博客首页
网友评论0 条评论
确定删除指定的回复吗?
确定删除本博文吗?