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建议组建国家生物信息学研究平台

已有 5945 次阅读 2013-12-27 16:03 |系统分类:科研笔记

建议组建国家生物信息学研究平台

 

建议内容:建议科技部组建国家生物信息学研究平台。

建议名称:《国家生物信息学研究中心》。

主要任务:1DNA和蛋白质测序技术研究和测序工作;2)搜集不同生物的DNAmRNA和蛋白质序列;3)提供序列查询和分析服务;4)研究分析方法;5)与NCBI等其它数据库建立联网;6)建立中文查询。

建议承担单位:建议由中科院、华大基因等单位联合组建

建议理由:

121世纪是生物科学的世纪,这已毋容置疑。后基因组时代(2001年人类基因组测序完成)生物科学的研究已经发生了重大变化,研究的特点体现在研究的内容繁多、工作量繁重;技术水平要求较高;研究的场所分散、要求全球性的技术合作和资料信息分享;海量的生物数据迅速膨胀(DNARNA和蛋白质序列,蛋白质二级结构和三维结构数据,蛋白质相互作用等数据);庞大的虚拟研究团队和海量的试验数据等特点催生了生物信息学的诞生。生物信息学已经成为生物科学研究的核心纽带,研究内容主要包括:

生物数据库的建立 

生物数据的收集、存储、管理与服务 

生物信息学分析方法的研究 

基因组序列测定、分析与基因注释 

基因表达数据的分析与处理 

蛋白质序列鉴定的质谱分析 

蛋白质结构预测 

蛋白质相互作用网络分析 

生物大分子的结构模拟与药物设计 

应用与发展研究 

………

在后基因组时代,生命被视为信息的载体,生命的一切特性都可以从信息的流动中得到实现。 

诺贝尔奖获得者W. Gilbert1991年就指出:传统生物学解决问题的方式是实验的。现在,基于全部基因都将知晓,并以电子可操作的方式驻留在数据库中,新的生物学研究模式的出发点应是理论的。一个科学家将从理论推测出发,然后再回到实验中去,追踪或验证这些理论假设 

2)我们国家生物科学的研究队伍十分庞大,有许多高校几乎全部是从事生物科学研究的单位每年发表数以万计的SCI论文。但我们使用和提交序列的网络数据库都是国外的数据库,比较常用的数据库如:美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的 Genbank ,欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的EMBL核酸序列数据库,日本国立遗传学研究所维护DDBJ数据库等;而我们国家却没有自己的数据库,也就是说我们的研究工作建立在国的研究平台之上。这些数据库都是以英语和其他国家语言构建的数据库,对我们国家科技人员的使用也有不便,阻碍了我们国家的研究发展。 

3)我个人认为:建立这样的数据库也不应该是一件难事。我们国家有龙芯计算机、有华大基因企业、有成千上万的生物科学家,建这么一个平台就是一个很简单的事。但这个平台的建成将会极大的促进我们国家生物科学的发展,也会为世界生命科学的发展做出巨大贡献。不仅如此,还会使我们国家在生物科学研究方面脚踏实地,建立起自己的研究体系。

这个建议仅为个人的看法。如果不对,请大家批评;如果国家已经建立,属本人孤陋寡闻;如果确实没有建立,还是建议国家考虑建一个。

 

 



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