之前在 Ubuntu 下编译过 Siesta. 参看：Ubuntu 下并行编译 Siesta。

最近在 Cygwin 环境下尝试编译 Siesta，笔记如下：

我在 Windows 7 64 bit 下安装 Cygwin 以后，都无法顺利编译 MPICH 或者 OpenMPI。解决办法是：安装 Cygwin 的时候就选择安装 OpenMPI，也就是凡搜索到符合 openmpi 字样的都选择安装。其他必须要安装的还包括：gcc，g++，gfortran，make，wget 等等。

但是且慢，谁能在初装 Cygwin 的时候就选好所有需要的程序呢？这不太可能。但也有解决办法：每次需要加装软件的时候就重新安装一次 Cygwin，只要安装到默认路径下，旧的系统并不会受到影响。

与 Ubuntu 下的安装相比，Cygwin 的 MPI 编译器位置是固定的，位于

/usr/bin/mpicc

/usr/bin/mpif90

等等位置。

Lapack的安装与 Ubuntu 相同，只不过在 make.inc 文件里 gfortran 的路径有所不同：

FORTRAN  = /usr/bin/gfortran

而 BLACS 的 Bmake.inc 要注意 MPI 路径部分选择：

  MPILIBdir = /usr/lib/

  MPIINCdir = /usr/include/

  MPILIB = /usr/lib/libmpi_mpifh.dll.a

尤其第三行的文件名。同时 MPI 编译器的路径是：

  F77            = /usr/bin/mpif77

  CC             = /usr/bin/mpicc

Scalapack 也只要注意在 SLmake.inc 里正确选择 MPI 编译器路径：

FC            = /usr/bin/mpif77

CC            = /usr/bin/mpicc

其他都一样。

编译 Siesta 2.0.2 的时候，要先更新软件包（Src 目录）里的 config.guess，参见 Cygwin 上 config.guess 无法工作的解决办法。然后还是要在 Src 目录下执行

./configure

修改生成的 arch.make 并注意以下细节：

FC=/usr/bin/mpif90

MPI_LIB=/usr/lib

即可。然后直接 make 就可以了。

Cygwin 既然效率不高，有时可能并不必要并行计算。编译 Siesta 串行版本极其简单，只要在安装 Cygwin 的时候选择安装 gfortran，再到 Siesta 2.0.2 的 Src 目录下先更新 config.guess，最后执行：

./configure

make

就可以了。