1. 安装CUDA
(1) $sudo yum install gcc gcc-c++
(2) $sudo yum install kernel-devel
(3) $sudo yum install kernel-devel-$(uname -r) kernel-header-$(uname -r)
(4) 禁用Nouveau。新建文件/etc/modprobe.d/blacklist-nouveau.conf，在其中写入以下两行：
blacklist nouveau
options nouveau modeset=0
输入命令：$sudo dracut --force
(5) 切换到文本模式：$systemctl set-default multi-user.taget
$sh ./cuda_xxx.run
(6) 切换到图形模式，重启
$systemctl set-default graphical.taget
安装后系统无法重启，重新安装CentOS 7。查询机器中的GPU型号：
$spci | grep -i nvidia
02:00.0 3D controller: NVIDIA Corporation GM108M [GeForce 940MX] (rev a2)
在cuda官网没有查询到对该GPU的支持信息，可能由于cuda对GPU不支持导致系统安装cuda后系统启动失败，故而放弃cuda安装。
2. 安装cmake
$cd /home/sunyp/software/source
$wget https://cmake.org/files/v3.11/cmake-3.11.1.tar.gz
$tar cmake-3.11.1.tar.gz -C ../build
$cd ../build/cmake-3.11.1
$bootstrap
$make
$sudo make install
3. 安装gromacs
$cd /home/software/source
$wget ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/gromacs-2018.1.tar.gz
$tar gromacs-2018.1.tar.gz -C ../build/gromacs-2018.1
$mkdir build
$cd build
$cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
$make
$make check
$sudo make install
$source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
$sudo ln -s /usr/local/gromacs/bin/gmx /usr/local/bin/gmx
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