1. PLM (Phylogenetic liner models)

   R package: phylolm

2. PGLM (Phylogenetic generalized liner models)

   R package: phylolm

3. PGLS (Phylogenetic generalized least squares models)

    R package: nlme

4. PGLMM (Phylogenetic generalized linear mixed models)

    R package: phyr

5.Nested ANOVAs

    R package: lme, ape

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