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平行计算 – 生物计算机原理

已有 3158 次阅读 2015-1-16 19:28 |个人分类:科学方法|系统分类:科普集锦| 计算机, 算盘, 生物计算机

一切都是计算,任何系统的输入与输出之间就是方程式的运算。

1999年在德国,我建立了“Biosystem Network- 系统生物学的世界第1家英文网站,阐述了结构论 - 从实证到综合的生物系统理论、实验与计算生物学方法和人工生物系统的仿生学与转基因技术整合的工程方法等,探讨生物的“基因型-表现型”复杂系统研究,并列出生物技术的仪器和生物信息学的软件公司,以及系统科学与数学相关理论资讯和贝塔郎菲、汤普森和R.Rosen等文献。

然而,常见提到“系统生物学”,片面理解成了胡德等“omics”生物学 - 属于实验技术维度,北野宏明等“in silico”的E-cell模型属于计算机模拟维度。“系统生物学”词汇1968年提出(属于理论生物学概念),现代的概念是1992-1999年阐述的理论、计算与实验、工程方法的生物系统研究,也包含生物系统的网络数学模型等维度。

工程方法设计与合成人工生物系统,可以开发细胞工厂、生物反应器和纳米机器、细胞计算机等。

机械计算器最早的是算盘,指令就是珠算的口诀,算盘的来源是筹算;然而,这需要人工计算,电子计算机只需输入和输出数据和程序。1992年在提出系统医药学时,也同时探讨了城市群的文化现象和可能突破诺依曼计算机模型的细胞代谢机制等。

合成生物学和细胞仿生学的发展,将可能导致颠覆计算机模型 - 实现平行计算的运算机制建立。

-(细胞仿生工程与遗传工程)-



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