学术界很多争论的困惑，在于概念的分析哲学基础欠缺扎实，如，科学与人文、宗教与科学、医学与科学、科学与工程等概念的辨析，以及体制是社会科学的应用，管理是工程等，而中国古代文化的显著特征是工程范式。

近现代科学是研究自然、社会乃至文化的机理或机制，也包括，对人工客体、人造机械等科学机理的研究；因而，可以看到诺贝尔奖基本授予现象及其机理的发现，以及发现知识与研究机理的方法和技术，却一般不会是只属于应用开发的工程设计与产品开发，如，转基因禽类输卵管生物反应器，细胞计算机和机器人设计等。

发现知识和研究机理的方法和技术属于科学范畴，而设计与制造产品的方法和技术属于工程范畴；但是，研究工程设计与技术开发的知识与原理，又属于科学 - 技术科学或工程科学。

宇宙演化到诞生人类，生命起源和大脑运行的机理是最大的科学谜团，如何揭示生命活动的机理和神经网络的发育等是科学研究的难题，而且，这是未来能够设计人工生物体和开发智能机器人的理论、方法和技术基础；然而，人工生命和智能机器的开发，却是应用科学知识的工程和技术。

-（生命科学与人工机器）-