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09概念的澄清

已有 1757 次阅读 2014-11-24 05:29 |个人分类:future|系统分类:科普集锦| 系统生物学, 合成生物学

近代科学的哲学基础,奠基于培根《新工具》的归纳逻辑、实验方法和笛卡尔《方法论》的演绎逻辑、数学方法。笛卡尔阐述了概念澄清的重要,科学的理论起点于概念,而哲学思维往往是分析和建立概念,系统生物学发展也是如此。

系统与合成生物的哲学基础,就是系统与综合哲学;因而,概念的思想和理论基础,也就追溯到欧洲最早的系统思维 莱布尼兹和康德,其中:

1)“系统”,包括,系统理论(systems theories)、系统方法(systems approaches)、系统测量(systematic measurements)和生物系统(bio-systems)等几个方面,系统生物学在2003年国际上形成了理论和实验、计算方法结合的生物系统研究概念。

胡德的系统生物学概念着重于组学和分子生物技术的系统测量,北野宏明的计算系统生物学着重于细胞的分子生物系统计算机模拟(simulations,1968年最初D.Mesarovic提出“系统生物学”术语为系统理论的概念。

2)“合成(synthetic)”,最初出现在康德和斯宾塞等哲学,往往翻译成综合哲学,以及化学的有机合成和生物学的综合进化论等领域,2003T.KnightD.Endy等阐述合成生物学为工程方法的系统生物学概念。

1910S.Leduc提出为化学合成生物的形态(forms),1953年米勒研究生命的化学进化实验和1974W.Szybalski用于DNA分子重组技术,在20世纪80年代也出现在计算机软件技术的合成概念;然而,2000E.Kool等重新提出,仍然是化学合成人工生物分子的概念。

3)系统医学与药物学,提出于中西医学、中西哲学比较研究;然而,已经脱胎于传统医学和实验、分子医学等,而建立在图论、网络拓扑学等数学和系统科学的理论基础上。

系统生物学,体现为研究方法和技术,系统遗传学,为生物进化与发育的“基因型-表现型”复杂系统机理研究,合成生物学和系统生物工程,则是系统生物学与遗传学的工程生物学方面和人工生物系统研究。

-(环太平洋文明)-



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