系统生物工程研究所筹建始于1994年转基因动物私立研究所和国际会议筹备，而后，又于2006年筹备到2008年注册组织机构而成立；然而，筹备2001年10月北京第1届国际系统生物科学与工程会议和2009年9月香山系统遗传学会议均未成功。

国际上，自1999年发起，而后，2000年至2013年，掀开了国际第1届会议和第1家研究所建立纪录：

1、系统生物学，2000年西雅图；合成生物学，2003年贝克利；系统生物科学与工程（D-BSSE）系，瑞士；系统医学，2008年美国；系统遗传学，2013年美国等研究所或系；

2、系统生物学，2000年东京；合成生物学，2004年美国；系统遗传学会议和专项基金，2008年美国；系统医学，2012年爱尔兰等国际会议或基金。

中国的第1届会议和研究机构纪录：

1、1996年北京第1届国际转基因动物学会议筹备国际转基因学协会，以及系统生物工程和生物系统理论，以及1999年在德国建立的网站等；

2、2005年-2006年上海系统生物医学研究所，2006年-2008年筹备和成立系统生物工程研究所等。

结论：国际第1纪录，除日本、中国有政府机构之外，几乎是民间或私立或大学学术机构主导而成 – 因而，学术界的科学精神和国际化精神是科学发展的动力所在。

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