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一个漫长的探索历程

已有 1029 次阅读 2014-1-24 03:44 |个人分类:2014y|系统分类:科普集锦| 系统生物学, 合成生物学

- 系统生物学的哲学基础

1968年美国西保留地大学举办的国际系统论与生物学会议Mesarovic D.提出系统生物学术语,1993年国际一篇文献德国Tolle TR.等再度提到系统生物学词汇;但是,包括,1993年之前的数学生物学、计算生物学和2004年之后的网络生物学,都是理论生物学概念。

1983年美国Seeman N.提出DNA纳米生物学概念,1992年美国华人Liang P.提出mRNA差异显示分析技术等,从而,进入理论与实验、计算与工程方法的生物系统与人工生物系统研究的概念。

21世纪的系统医学与系统生物工程等概念生物系统的理论与实验、计算与工程研究方法,中国Zeng BJ.提出于20世纪90年代,经历中国和海外2个阐述时期*

国内时期:1992-1993年发表系统医药学等概念和结构论等,1994年发表系统生物工程、系统遗传学概念和转基因禽类输卵管生物反应器等。

国际时期:1996年筹备国际协会与会议和1999年建立系统生物科学与工程网等,阐述生物系统理论和系统生物工程等,2003年在第19届国际遗传学大会阐述系统遗传学概念和原理等。

1999年之后,美国华盛顿大学分子生物技术系Hood L.、日本e-cell课题组H.Kitano论述组学的实验生物技术和计算机软件模拟的计算生物学。再后,美国Knight T.E.Endy等论述工程方法和工程系统生物学的合成生物学概念;但是,2000年之前,合成生物学是化学合成和DNA重组技术概念。

1983年形成和1986年著述、1993年发表的结构论是系统的自组织理论,阐述了系统科学与综合(synthetic)哲学和提出结构整合、稳态调适和建构分层等3条规律。生物系统的结构理论,建立在生物进化论和形态发生的图论、拓扑学原理上,也是有机体的机器哲学和人工设计概念基础上。

近现代实证科学的建立,就是基于工程技术和数学方法的概念,或机器构造与设计的哲学思维**,生物科学要成为可以实践应用的知识体系,也必须是建立在可以人工设计与制造的机器观念上 - 生物机器和结构理论;但是,有机体机器是活的机器,需要新的科学方法和技术发展。

附:科学范式,涉及到科学历史、方法和哲学,也涉及到文化、社会和建制等。

* - 1985年大学毕业到1993年任讲师,经历8年系统与科学哲学思考;然后,组织1996年国际转基因会议任秘书长,转入国际化交流。1997年留学海外到2003年任研究员和主持基金会课题经费,经历6年时间;然后,转入文化与社会哲学探索。

** - 参见http://blog.sciencenet.cn/blog-39472-761417.html

(美国韦斯特福尔的《近代科学的建构》导言概括说:两个主题左右着17世纪的科学革命 - 柏拉图-毕达哥拉斯传统和机械论哲学。柏拉图-毕达哥拉斯传统以几何关系来看待自然界,确信宇宙是按照数学秩序原理建构的;机械论哲学则确信自然是一架巨大的机器,并寻求解释现象后面隐藏的机制。

-1983-2013年探索)-



http://wap.sciencenet.cn/blog-286952-761753.html

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1 曹聪

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