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系统生物学方法

已有 1554 次阅读 2013-10-11 03:50 |个人分类:2013|系统分类:科普集锦| 系统生物学, 合成生物学

- 纲领

V1.0系统生物学(1968D.Mesarovic系统论与数学方法的生物学研究。

V2.0系统生物科学与工程(1994-1999BJ.Zeng理论与实验、计算与工程方法的生物系统与人工生物系统研究。

1999-2001年开始:

1)理论与数学方法 系统理论、数学模型等,

比如,DB.KellO.Wolkenhauer等;

2)计算与拓扑网络 计算机模拟、网络科学等,

比如,N.NobelA-L.Barabási等;

3)组学与芯片实验 分子表达谱、数据分析等,

比如,L.HoodR.Aebersold等;

4)纳米与工程设计 基因合成、模块设计等,

比如,E.KoolAP.Arkin等。

V3.0系统遗传学与医药学(1992-1994BJ.Zeng生物系统论和系统分析与综合。

2003-2007年开始:

1)“基因型-表达型”复杂系统 分子网络、细胞周期和动力学,

比如,S.LeiblerB.Palssonvan OudenaardenR.LindingM.Kirschner等;

2)生物计算机和细胞工厂 基因回路、信号传导和代谢网络等系统设计与人工合成,

比如,

代谢工程 - J.NielsenJ.Keasling

细胞计算机 - T.KnightD.Endy*

基因合成与建构 - G.ChurchHO.Smith

分子调控模块 - J.CollinsC.Voigt等。

其中,

V1.0V2.0-1)系统科学理论基础,包括,控制论、信息论和耗散结构论、超循环论、混沌理论和非线性动力学等;

V3.0为生物系统的机理和设计,

揭示进化-发育和病理发生机理,筛选药物和生物制药,开发生物能源、传感器和反应器等人工生物系统。

注*:

论述合成生物学,转换成了系统生物学的遗传工程概念。

-(工程医学-生物系统设计)- 



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