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系统生物学术语

已有 2579 次阅读 2013-3-8 10:18 |个人分类:资讯|系统分类:科普集锦| 网络, 生物学, 医学, 系统, 整合

涉及系统生物学的最早学科术语,1958年的系统心理学(systems pyschology),生物系统科学和生物系统工程(biosystems science and engineering)不知是否比它早,也依然没有检索到是谁提出,但最初是用于生态系统和农业科学,1963年的系统生态学,应该是对等概念。
然后,1968年是Mesarovic D提出系统生物学(systems biology),他与R.Rosen编辑了这次系统论与生物学(systems theory and biology)会议论文集,并发展了数学生物学,我本人是80年代思考拓扑生物学,读到R.Rosen的论文开始了系统生物学的探索。
20世纪70年代的系统生理学也得以发展,主要属于器官系统生理学,但采用生物控制论、系统论等研究方法和数学,免疫系统的网络理论(network theory)、生物化学系统论和代谢系统控制论、分子动力学和超循环等理论也发展了起来。80年代的计算机技术发展,而开始了计算生物学和计算机方法的生物系统建模,基因组计划的进展,形成了生物信息学和组学分子生物技术;因此,到20世纪80年代,已经形成了系统生物学的数学生物学、计算生物学的方法,以及贝塔郎菲提出的理论生物学,他也提出过有机体生物学(organism biology)。
1992年日本有一篇文章的题头是系统生物医学,但属于工程学和器官系统的研究体系,1992年我本人在中西医学比较研究和拓扑生物学、图论等,包括四色定理等研究中,提出了经络系统并非实体,而可能是人体机能的数学模型,如同,天象图、河洛图等,采用的易学等是一种组合、集合、拓扑和图论等图式(schema)型的数学方法和类比、同态、构型等系统思维。1994年进而从医学遗传学、心身医学、诺伊曼自动机等开始深入到细胞的分子系统层面,从而,提出了系统遗传学和系统生物工程等。
1994年到中关村,中科院微生物学研究所和发育生物学研究所,在转基因动物、分子生物学和生物信息技术,互联网在线生物信息检索和基因分析等,以及差异显示分析技术和细胞信号传导、代谢系统和基因调控网络等(德国宝林曼公司,现Roche公司挂图*)研究,从而将系统生物科学的理论与技术结合了起来 - 即,生物系统理论和实验、计算(computational)方法的生物系统研究。
1996年在北京举办转基因动物研究的国际会议,1999年在德国建立生物系统网络(biosystem network)网站。这几年的规模化国际通讯,包括生物系统理论、系统生物工程和系统生物科学的定义等。几乎遍历了国际上大学、研究机构涉及生命和医学问题的网页,也在实验室少不了辩论,但依然传统的分子生物学思维根深蒂固。
到了1999年-2000年,突然间,从数学、计算、化学、纳米和组学生物学,以及合成生物学(1910年词汇)、网络生物学(2004年词汇)等领域大量论文发表,并宣称为整合方法的系统生物学研究,而在2003年形成了诸多学派。计算、网络等作为术语的定语,或组学等作为词汇后缀,迅速扩展到生物科学、医学与工程等领域。 
注*:
这2张挂图(http://abeautifulwww.com/2008/05/29/network-visualization-for-systems-biology/),为了筹备国际会议和协会,我从北京带到以色列,又带到德国;然后,没有再带走了。
另外,我儿时玩的一双筒望远镜(铜制和3国欧洲语言标示)也一直带到国外;但是,在英国时被盗。


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1 武夷山

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