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1992年-1994年实际是系统生物学的理论、数学和计算机方法与实验、技术和工程方法的划界时期,或系统生物学与系统生物工程的2个阶段。1996年-1999年(BSSE网站)论述的生物系统理论(结构论)与系统生物技术的结合为现代系统生物学,系统科学方法研究生物系统构成理论部分,实验、计算生物学等方法构成技术部分。
1991年,系统科学与人工智能、基因工程的太阳能生物电子技术概念,代谢工程的提出,1992年mRNA差异显示分析技术*(2011年Ideker论文中系统生物学的技术年表起点)等,可说明系统生物学的技术和工程方法起始,发展到信号传导路径与基因调控网络等系统研究。
1989年的生物化学系统论与计算机数学建模国际会议,已经是计算生物学和代谢和分子系统层面的研究,而在70年代的免疫网络理论等是现代网络生物学的起点,1968年系统生物学词汇提出之时已经发展了数学生物学,贝塔朗菲的系统论和数学方法研究生物系统是理论生物学概念。
2001年-2003年国际上几乎同时发表系统论、组学(omics)、计算(in silico)和工程(合成)等方法研究系统与合成生物学的论文,并形成理论、组学、计算、合成和网络生物学学派。2007年瑞士建立D-BSSE,2008年国际上论述系统与合成生物学的结构论,2012年国际系统医学大会召开,等。
注*:
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