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1983-2016年曾邦哲（BjZeng）的学术思想，包括 -A-城市群-道德经济学与行星际文明（及李约瑟难题-钱学森之问），B-系统医学-系统遗传学与生物工程（及系统与合成生物学的BSSE概念与方法），C-结构论-4世界与4轴心时代理论，以及D-机器理论（生物学3.0与第四次工业革命 - 工程医学与生物工业）-纳米机器（人工智能与合成生物）设计3原则等。
20世纪80年代到90年代，实际上，BjZeng是在中西医学比较和计算机与生物学比较的过程，从生理学与遗传学和仿生学与转基因技术的切入层面，开始了系统生物科学与工程（BSSE）-系统科学与人工智能和基因工程等探讨 - O网页链接仿生学bionics与转基因技术transgenics等。
O网页链接 - 系统生物学的真正起点是1992-1999年，即系统与合成生物学的范式建立。
1-2-发展简史 - 其中，1996-2000年BjZeng分别与l.Hood-M.Tomita-N.Seeman通信，2001年BjZeng在biosystem network网站*列有E.Kool-E.Hafen-T.Pawson的文献和1994-1999年列有R.Rosen和DW.Thompson的有关系统与合成生物学术语的文献，并将其理论与分子生物学概念转换到系统生物科学与工程偶合与转换的概念和理论、实验与计算生物学结合的方法体系。
核心方法-其1-网络拓扑分析，其2-细胞分子电路概念图，其3-生物电子学设计，其4-非线性细胞动力学。
1996-1999年BjZeng组织国际会议与筹备国际学会是目的 - 国际转基因协会和系统生物科学与工程协会，导致了大规模的国际通信。
1999-2007年系统与合成生物学的国际学术共同体形成，2007-2016年国际上进入产业化发展过程。
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合成生物学的真正起点 -1992年到1999年曾邦哲（BjZeng）的系统医学（2012年欧盟成立组织与协会和2013年中国医科院成立研究所）-系统遗传学（2014年纽约大学建立研究所1）与系统生物工程（美国MIT研究中心和天津大学教育部重点实验室2）概念和方法体系。
之前只有词汇，并是分子生物学与基因工程，1996年到1999年曾邦哲把系统生物学（理论生物学概念）与合成生物学（分子生物学概念）转换到系统生物科学与工程（2007年瑞士ETH建立研究中心）的偶合概念与方法体系，核心是提出生物系统理论与网络拓扑学（分子与细胞网络）分析和生物电子学（细胞通讯与分子电路）设计方法。
这是在中国本土提出而在国际上形成学术共同体的第一个完整体系的学科体系 - 国际上称之为一场科学革命。
其中1和2合作（爱丁堡大学和华大基因也参与了）合成酵母染色体，就是之前的新闻O网页链接，这是在1（与该所2014年刚成立时有过几次email）之前的合成酵母染色体基础上的规模化发展。
英国院士Kitney在2007年称系统与合成生物学**将导致工业革命，而2011年曾邦哲把计算机与互联网列为一次工业革命和论述了4次工业革命。
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- 而keasling是2003-2007年在加州贝克利合成生物学研究所成功实现在酵母表达青蒿素，2007年苏新专和米勒来华考察青蒿素的发现，而后每年米勒向诺贝尔奖和拉斯克奖推荐屠呦呦，2011年屠获得拉斯克奖，12月Nature专栏发表系列文章论述中医药研究与系统生物学方法，2015年欧盟系统医学组织在瑞典举办夏季课程。
2015-2016年美国实现了禽类输卵管生物反应器（1994年曾邦哲提出的方案，1996年美国avigenics公司与曾邦哲通信之后开启的项目）表达药用蛋白质，以及实现了合成生物技术的工程免疫细胞精准治疗肿瘤的转化医学。
其中，2003年成立贝克利大学合成生物学研究所的AP.Arkin参与了2000年11月（10月发布的通知）M.Tomita***和H.Kitano在东京举办的第一届系统生物学国际会议，并于2001年发表论述合成细胞生物学与工程设计方法 - 即系统生物工程，2014年开展NASA用于太空的合成生物学项目O网页链接 - 即，将来可以用于改造火星的合成生物学计划。
O合成生物学迎来机器人革命 -
1996年BjZeng组织第一届国际转基因动物学术研讨会与筹备国际转基因协会（包括邀请TransgenicResearch为会刊） - 在国际上发起系统生物工程（系统与合成生物学）的研究，1999年建立biosystem network英文网站和筹备国际BSSE协会（倡导生物系统的理论和实验与计算生物学方法整合，以及基因组智能与人工生物系统的工程设计等研究），2008年BjZeng成立SBE研究所ltd.，启动了系统与合成生物学的芯片实验室技术 - 细胞分析与人工合成（1995年BjZeng采用基因片段组装合成全基因的方法，1997年建立连续突破筛选耐药细胞的技术）开发项目。
附-A-1996-2006年显现绘画与幻象诗歌-哲理小说《星际情殇》。
B-1991-1996年在湖南（衡阳-湘潭）到广州和天津-北京和上海的过程阐述1-生物系统与人工生物系统研究和2-城市群与地缘文化模式分析等，2007-2012年广州-长三角（古镇）阐述第3-4次工业革命和工程医学等，1997-2006年在以色列（宗教中心）-德国汉诺威（莱布尼茨）-英国伯明翰（汤普森）探讨非线性细胞发生动力学与生物计算机（仿生学与转基因技术整合）和道德经济学等。O网页链接 - 生命的设计与构建，莱布尼茨曾经说过：“世界上没有两片完全相同的树叶”。
C-从牛顿苹果-图灵苹果和乔布斯苹果到“4色苹果”（2004年BjZeng预测2009-2016年危机的预言诗） - 生物计算机与合成生物学。O网页链接 - 费曼说的：我不能创造的东西，我就不了解。What I can not create, I do not understand. - O网页链接 - 探寻大脑的规律，思维框架与物理学方法
注：
*-1999年元月曾邦哲建立生物系统网络的英文网站，10月和12月在国际刊物刊登筹备国际协会与会议的通知及其链接，同年10月L.Hood- 12月H.Kitano分别注册系统生物学的域名。
**-生物学3.0 - 系统与合成生物学，结构与分子生物学 - 生物学2.0等。
***-2000年初曾邦哲邀请M.Tomita参与组织2001年北京第一届国际系统生物科学与工程会议。
O网页链接 - 国外合成生物学重大项目及最新应用成果
（2017年网络日记）