结构论 – 4世界与4轴心时代理论，在系统与科学哲学的基础上，采用图论与网络拓扑学方法等，吸纳了中医理论的哲学思想内核和城市群的文化创造与传播等，尤其轴心时代思维模式的方法论分析，建立的是自组织系统的自组装或自编织理论。

1910年S.Leduc合成生物学是化学概念，在1974年和1980年用于基因重组概念，2000年E.Kool重新提出仍为人工xDNA化学合成，总之仍然属于分子生物学与分子化学的范畴。

1968年Mesarovic D.提出应用系统理论的系统生物学，到1993 年重新出现在Tolle TR的论文仍属于理论生物学和数学模型等概念。1992年的系统生物医学词汇和之前的系统生理学和系统生态学等，基本属于代谢系统、器官系统、生态系统等概念和系统理论与控制论等研究，包括，生物化学控制论等研究。

1992-1994年系统医学– 系统遗传学与系统生物工程的提出，并1996-1999年系统与合成生物学转换到生物系统的科学与工程偶合模式，则是在细胞分子生物系统层面的理论生物学与计算生物学、实验生物学等整合的方法，包括，采用药物化学领域的计算机模拟和计算机辅助设计等，以及微电子学领域的工程设计原理等。

因而，组学（omics）表达谱与实验数据分析，或计算机数学建模与软件模拟（in silico）等，分别属于1）分子生物技术与2）生物信息技术方法部分，而且，系统生物学是交叉与综合科学。