许培扬博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xupeiyang 跟踪国际前沿 服务国内科研

博文

微生物组国际研究前沿热点分析报告(1)

已有 4889 次阅读 2016-5-15 07:07 |个人分类:信息分析|系统分类:科研笔记

      微生物组国际研究期刊影响因子20以上;H指数130以上的科研成果论文560篇分布如下:可以看到微生物组研究的国际名人、名刊、名文。微生物组研究人员应该关注这些国际一流论文。

      近三年国际研究成果论文增长很快,美国、英国、德国论文很多,中国大陆科研论文第七位,深圳、上海的研究成果突出。大家应该看看主要的研究主题领域。

最新研究动态与进展如下:

美政府启动“国家微生物组计划”

新华社华盛顿5月13日电(记者林小春)美国奥巴马政府13日宣布启动“国家微生物组计划”,旨在推进对微生物世界的认知,从而在卫生保健、食品生产和环境恢复等领域有所应用。

“‘国际微生物组计划’的启动标志着微生物组学的一个里程碑,”白宫科技政策办公室副主任、微生物学家乔·汉德尔斯曼在白宫网站上的一篇博客中写道,“我们期盼‘国家微生物组计划’促进这个重要领域取得进展,给我们的星球及其居住者带来可观效益。如果有一件事我们可以确信,那就是微生物虽小,但它们的影响巨大。”

白宫发表的一份声明指出,多年来,美国政府一直在微生物组领域投资,且近年来力度不断增加。2014财年的联邦投资是2012财年的3倍,在3年间的总投资超过9.22亿美元。未来两年,美国政府计划再投资1.21亿美元,用于“国家微生物组计划”。

http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2016/5/345978.shtm

中国要积极参与组织“微生物组计划 ” 

上海交通大学 赵立平 

  “微生物”是指由多种微生物聚居在一起形成的生群落,从人和物的道,到植物、土壤、海洋,它不在,推着地球物环,影响着人体乃至整个地球生物圈的健康。小到一个工厂的污水处理,大到温室气体排放造成气候变暖,人类面临的能源短缺、环境污染、粮食安全、疾病流行等几乎所有问题的背后,都有微生物的身影。

  由于组成复杂、分布广泛,影响深远,微生物组成为与人的大脑并列的、作用巨大但又尚未被充分认识的复杂生物系统。解析微生物组对人类面临的健康、能源、粮食、环境等重大问题的作用机制,发展全新的解决办法,需要采取新的多学科交叉和国际化协作的大科学计划的组织模式。

  为此,2015年10月29日,上海交通大学的赵立平教授会同美、德科学家,在《自然》周刊发文,呼吁实施“国际微生物组计划”,组织多个国家的多学科的研究力量、围绕严重影响人类和地球生物圈健康的重大科学问题,对微生物组的作用加以深入研究,为从根本上解决困扰人类的慢性病流行、环境污染和能源短缺等重大问题,提供全新的研究思路和技术手段。例如,糖尿病、癌症、老年痴呆等主要疾病的发病机制和防治方法的根本性突破,可能就在于如何在数千种细菌构成的肠道菌群里,把产生引发炎症的毒素、致癌物质和神经毒素的细菌找出来,并研究清楚其致病机制,因此“仅人体微生物组领域就可能孕育多个诺贝尔奖级别的理论成果”,而且,会成为推动新的产业形态的形成和发展的强大的技术创新的发动机。

  由于微生物在人类和地球生物圈健康中的巨大作用,此前美国已经部署有“从基因组到生命”计划(2002年启动),“人体微生物组”计划(2008年启动,总投资1.7亿美元)、“地球微生物组”计划(2010年启动);日本有“人体元基因组研究”计划(2005年启动),加拿大有“微生物组研究”计划(2007年启动),欧盟有“人类肠道元基因组”计划(2008年启动)等,都主要侧重微生物资源调查和微生物组在能源、健康领域的应用。美国2015年新提议的“联合微生物组研究计划”(该计划每年至少有4亿美元,未来2-5年,可能上升到5-6亿美元/年)强调需要同时注重微生物组在健康、农业、环境、生态等方面的应用潜力。2016年5月13日,美国白宫政策办公室宣布启动“国家微生物组计划”,就是联合微生物组计划的正式版本。这是奥巴马政府推出的与脑科学计划、精准医学计划等并列的重大科学计划。毫无例外,美国政府推出的这个新的科学计划会又一次成为世界科技发展的风向标,令世界各国纷纷跟随。

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=34761&do=blog&id=977251

关于尽快启动“中华民族人体微生物组计划”的建议

Chinese Human Microbiome Project, C-HMP 

赵立平 上海交通大学 

  中华民族是有文字记载的历史最悠久的民族之一,也是唯一经历了无数的战乱和瘟疫,能在其发源地延续至今而依然生机勃勃的人类古文明,更是地球上人口最为众多,分布也最为广泛的民族。

  中华民族在长期的繁衍生息中,积累了大量的控制疾病、促进健康的经验,以中医、藏医、蒙医、苗医等多种传统医学形式流传下来,至今在国民保健防病中依然发挥着不可忽视的作用。

  最近十年来,国际生物医学领域的一个重大研究进展为中华民族提供了一个全民族提升健康水平,同时也为人类健康作出突出贡献的重大机遇——这就是“人体共生微生物在疾病与健康中的作用研究”。

  1958年的诺贝尔奖获得者里德伯格指出,人体是一个由人的细胞和所有共生微生物的细胞构成的“超级生物体”,也是一个非常复杂的生态系统。在人的身体内外生活的微生物的细胞数量甚至是人体自身细胞数量的10倍,有百万亿之多。超过90%的共生微生物生活在人的消化道里,称为“肠道菌群”,但是,人体的皮肤、呼吸道、生殖道等等所有能与环境接触到的地方全部都有自己的菌群。全身各个部位的菌群编码的基因数量超过人的基因组里基因数目100倍,被统称为人体微生物组(Human Microbiome)。

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=34761&do=blog&id=977256

 

数据来源  http://www.pubmedplus.cn/

年份年份趋势图
记录数
占%
01.2016     56 10.000%
02.2015     143 25.536%
03.2014     118 21.071%
04.2013     77 13.750%
05.2012     60 10.714%
06.2011     36 6.429%
07.2010     21 3.750%
08.2009     16 2.857%
09.2008     9 1.607%
10.2007     4 0.714%
查看更多
期刊期刊分区中科院期刊分区
记录数
占%
01.nature     141 25.179%
02.science     134 23.929%
03.cell     83 14.821%
04.nat rev immunol     39 6.964%
05.nat med     37 6.607%
06.nat biotechnol     24 4.286%
07.nat immunol     24 4.286%
08.n engl j med     16 2.857%
09.jama     11 1.964%
10.lancet     11 1.964%
查看更多
国家国家分布图
记录数
占%
01.美国     234 41.786%
02.英国     34 6.071%
03.德国     31 5.536%
04.法国     25 4.464%
05.加拿大     17 3.036%
06.澳大利亚     12 2.143%
07.中国大陆     11 1.964%
08.以色列     11 1.964%
09.日本     11 1.964%
10.瑞士     9 1.607%
11.丹麦     6 1.071%
12.意大利     6 1.071%
13.比利时     6 1.071%
14.瑞典     6 1.071%
15.西班牙     6 1.071%
16.荷兰     4 0.714%
17.韩国     3 0.536%
18.中国香港     2 0.357%
19.奥地利     2 0.357%
20.孟加拉国     2 0.357%
21.巴西     2 0.357%
22.沙特阿拉伯     2 0.357%
23.爱尔兰     2 0.357%
24.中国澳门     1 0.179%
25.匈牙利     1 0.179%
26.土耳其     1 0.179%
27.挪威     1 0.179%
28.新加坡     1 0.179%
29.新西兰     1 0.179%
30.特立尼达和多巴哥     1 0.179%
31.葡萄牙     1 0.179%
32.阿拉伯联合酋长国     1 0.179%
33.阿根廷     1 0.179%
34.马里     1 0.179%
大陆城市境外城市
记录数
占%
01.广东省广州市     3 0.536%
02.广东省深圳市     3 0.536%
03.上海市     2 0.357%
04.四川省成都市     1 0.179%
05.江苏省南京市     1 0.179%
06.江西省赣州市     1 0.179%
07.浙江省杭州市     1 0.179%
大陆机构第一作者机构合著机构境外机构
记录数
占%
01.深圳华大基因研究院     4 0.714%
02.上海交通大学校本部     3 0.536%
03.华南理工大学     3 0.536%
05.bgi shenzhen     1 0.179%
08.东南大学校本部     1 0.179%
10.中国科学院未分类     1 0.179%
查看更多
主题词主题词搭配主题词与主题词
记录数
占%
01.microbiota     176 31.429%
02.metagenome     126 22.500%
03.intestines     121 21.607%
04.bacteria     96 17.143%
05.gastrointestinal tract     93 16.607%
06.symbiosis     64 11.429%
07.mice, inbred c57bl     58 10.357%
08.feces     57 10.179%
09.germ-free life     54 9.643%
10.intestinal mucosa     54 9.643%
11.anti-bacterial agents     42 7.500%
12.inflammation     36 6.429%
13.immunity, innate     34 6.071%
14.obesity     34 6.071%
15.diet     32 5.714%
16.homeostasis     31 5.536%
17.rna, ribosomal, 16s     31 5.536%
18.molecular sequence data     30 5.357%
19.phylogeny     28 5.000%
20.genome, bacterial     25 4.464%
21.biodiversity     24 4.286%
22.immunity, mucosal     24 4.286%
23.signal transduction     24 4.286%
24.sequence analysis, dna     23 4.107%
25.bacteroides     22 3.929%
26.colitis     22 3.929%
27.inflammatory bowel diseases     21 3.750%
28.intestine, small     20 3.571%
29.metagenomics     20 3.571%
30.colon     19 3.393%
31.bacterial physiological phenomena     18 3.214%
32.health     18 3.214%
33.probiotics     17 3.036%
34.t-lymphocytes, regulatory     17 3.036%
35.host-pathogen interactions     16 2.857%
36.models, biological     16 2.857%
37.time factors     16 2.857%
38.disease models, animal     15 2.679%
39.genomics     15 2.679%
40.mice, knockout     15 2.679%
41.biological evolution     14 2.500%
42.genes, bacterial     14 2.500%
43.immune tolerance     14 2.500%
44.mice, transgenic     14 2.500%
45.neoplasms     14 2.500%
46.specific pathogen-free organisms     14 2.500%
47.clostridium difficile     13 2.321%
48.ecosystem     13 2.321%
49.escherichia coli     13 2.321%
50.immune system     13 2.321%
Substance化学药中药
记录数
占%
01.anti-bacterial agents     42 7.500%
02.rna, ribosomal, 16s     31 5.536%
03.cytokines     12 2.143%
04.interleukin-17     12 2.143%
05.fucose     9 1.607%
06.inflammasomes     9 1.607%
07.interleukin-10     9 1.607%
08.bacterial proteins     8 1.429%
09.bile acids and salts     8 1.429%
10.dietary fats     8 1.429%
查看更多
疾病症状治疗方法物种解剖食品
记录数
占%
01.感染     74 13.214%
02.消化系统疾病     74 13.214%
03.营养与代谢疾病     68 12.143%
04.胃肠疾病     67 11.964%
05.肠道疾病     63 11.250%
06.胃肠炎     57 10.179%
07.肥胖症     46 8.214%
08.细菌感染与真菌病     44 7.857%
09.营养障碍     44 7.857%
10.营养过剩     39 6.964%
11.细菌感染     38 6.786%
12.肿瘤     37 6.607%
13.扭伤与劳损     34 6.071%
14.炎症性肠病     34 6.071%
15.代谢疾病     32 5.714%
16.结肠疾病     32 5.714%
17.结肠炎     31 5.536%
18.免疫系统疾病     26 4.643%
19.葡萄糖代谢障碍     26 4.643%
20.糖尿病     22 3.929%
21.动物疾病模型     19 3.393%
22.动物疾病     18 3.214%
23.革兰氏阴性菌感染     18 3.214%
24.肠杆菌科感染     16 2.857%
25.胰岛素抵抗     16 2.857%
26.内分泌系统疾病     15 2.679%
27.2型糖尿病     14 2.500%
28.高胰岛素血症     13 2.321%
29.消化系统肿瘤     12 2.143%
30.病毒性疾病     12 2.143%
31.自身免疫疾病     12 2.143%
32.皮肤与结缔组织疾病     11 1.964%
33.梭菌感染     10 1.786%
34.沙门菌感染     10 1.786%
35.肝疾病     10 1.786%
36.超敏反应     10 1.786%
37.革兰氏阳性菌感染     10 1.786%
38.crohn病     9 1.607%
39.呼吸道疾病     9 1.607%
40.哮喘     9 1.607%
41.寄生虫病     9 1.607%
42.小肠结肠炎     9 1.607%
43.心血管疾病     9 1.607%
44.溃疡性结肠炎     9 1.607%
45.肺疾病     9 1.607%
46.营养不良     9 1.607%
47.rna病毒感染     8 1.429%
48.结直肠癌     8 1.429%
49.胃肠癌     8 1.429%
50.脓毒症     8 1.429%
科室学科
记录数
占%
01.生物学     7 1.250%
02.内分泌学     4 0.714%
03.消化病学     4 0.714%
04.免疫学     3 0.536%
05.传染病学     2 0.357%
06.病原生物学     2 0.357%
07.精神病与精神卫生学     2 0.357%
08.中医学     1 0.179%
09.儿科学     1 0.179%
10.化学     1 0.179%

PUBMED数据库检索到24129篇论文分布如下:

年份年份趋势图
记录数
占%
01.2016     2406 11.153%
02.2015     4904 22.732%
03.2014     4085 18.936%
04.2013     2704 12.534%
05.2012     1991 9.229%
06.2011     1299 6.021%
07.2010     908 4.209%
08.2009     688 3.189%
09.2008     521 2.415%
10.2007     400 1.854%
查看更多
期刊期刊分区中科院期刊分区
记录数
占%
01.plos one     1278 5.924%
02.appl environ microbiol     494 2.290%
03.front microbiol     256 1.187%
04.sci rep     247 1.145%
05.proc natl acad sci u s a     242 1.122%
06.gut microbes     229 1.062%
07.isme j     228 1.057%
08.fems microbiol ecol     208 0.964%
09.br j nutr     182 0.844%
10.environ microbiol     181 0.839%
查看更多
国家国家分布图
记录数
占%
01.美国     5214 24.169%
02.中国大陆     1252 5.804%
03.英国     1056 4.895%
04.法国     868 4.024%
05.德国     802 3.718%
06.西班牙     795 3.685%
07.意大利     777 3.602%
08.加拿大     770 3.569%
09.日本     634 2.939%
10.巴西     616 2.855%
查看更多
大陆城市境外城市
记录数
占%
01.北京市     185 0.858%
02.上海市     179 0.830%
03.浙江省杭州市     106 0.491%
04.江苏省南京市     100 0.464%
05.广东省广州市     81 0.375%
06.湖北省武汉市     54 0.250%
07.四川省成都市     43 0.199%
08.重庆市     37 0.172%
09.陕西省西安市     31 0.144%
10.四川省雅安市     27 0.125%
查看更多
大陆机构第一作者机构合著机构境外机构
记录数
占%
02.中国科学院未分类     77 0.357%
04.浙江大学校本部     55 0.255%
05.南京农业大学     45 0.209%
06.中国农业大学     43 0.199%
08.四川农业大学     27 0.125%
09.西北农林科技大学     20 0.093%
查看更多
主题词主题词搭配主题词与主题词
记录数
占%
01.microbiota     3526 16.345%
02.bacteria     2872 13.313%
03.intestines     2013 9.331%
04.gastrointestinal tract     1977 9.164%
05.feces     1799 8.339%
06.metagenome     1772 8.214%
07.rna, ribosomal, 16s     1673 7.755%
08.dna, bacterial     1304 6.045%
09.probiotics     1251 5.799%
10.phylogeny     1129 5.233%
查看更多
Substance化学药中药
记录数
占%
01.rna, ribosomal, 16s     1673 7.755%
02.dna, bacterial     1304 6.045%
03.anti-bacterial agents     890 4.126%
04.dna, ribosomal     439 2.035%
05.prebiotics     349 1.618%
06.bacterial proteins     300 1.391%
07.cytokines     296 1.372%
08.oligosaccharides     270 1.252%
09.rna, bacterial     265 1.228%
10.fatty acids, volatile     249 1.154%
查看更多
疾病症状治疗方法物种解剖食品
记录数
占%
01.感染     3434 15.918%
02.肠道疾病     2594 12.024%
03.扭伤与劳损     2551 11.825%
04.消化系统疾病     2391 11.083%
05.胃肠疾病     2234 10.356%
06.细菌感染与真菌病     1695 7.857%
07.炎症性肠病     1616 7.491%
08.细菌感染     1433 6.643%
09.胃肠炎     1432 6.638%
10.肥胖症     1383 6.411%
查看更多
科室学科
记录数
占%
01.department of medicine     832 3.857%
02.department of microbiology     558 2.587%
03.department of pediatrics     479 2.220%
04.department of microbiology and immunology     384 1.780%
05.department of biology     348 1.613%
06.school of medicine     340 1.576%
07.department of internal medicine     316 1.465%
08.division of gastroenterology     289 1.340%
09.department of pathology     270 1.252%
10.department of gastroenterology     223 1.034%
查看更多





https://wap.sciencenet.cn/blog-280034-977258.html

上一篇:一了百了
下一篇:微生物组国际研究前沿热点分析报告(2)
收藏 IP: 114.111.167.*| 热度|

1 张成岗

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (3 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-3-28 19:44

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部